RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608842.1

DGCR6-208, Transcript of DiGeorge syndrome critical region gene 6, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene DGCR6, Length 1,837 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DGCR6-208ENST00000608842 KIAA0825Q8IV33 1275 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 SIPA1L1O43166 1804 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 NCLP19338 710 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 TFAP4Q01664 338 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 C8orf76Q96K31 380 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 AIFM3Q96NN9 605 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 SGIP1Q9BQI5 828 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 GJB4Q9NTQ9 266 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 USP40Q9NVE5 1235 aa27.25■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP27.24■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 RASA1P20936 1047 aa27.24■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 POLD1P28340 1107 aa27.24■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 IARSP41252 1262 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 KRT85P78386 507 aa27.24■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 MBD3O95983 291 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 NUP133Q8WUM0 1156 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 UBE2Q2LH0YL09 131 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 CDK8P49336 464 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 PPP2R5BQ15173 497 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 TTC6Q86TZ1 520 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 ANKS1AQ92625 1134 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 MKNK2Q9HBH9 465 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 PIM2Q9P1W9 311 aa27.23■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa27.22■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 DDAH1O94760 285 aa27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 PICALMQ13492 652 aa27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 CATIPQ7Z7H3 387 aa27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 ALG1Q9BT22 464 aa27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 ELP1O95163 1332 aa27.21■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 GABPAQ06546 454 aa27.2■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 DGKHQ86XP1 1220 aa27.2■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 SLC26A6Q9BXS9 759 aa27.2■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.95
DGCR6-208ENST00000608842 UBE2HP62256 183 aa27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 FUT2Q10981 343 aa27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 VPS33BQ9H267 617 aa27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 TMEM63CQ9P1W3 806 aa27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 SERPINA10Q9UK55 444 aa27.2■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CALM1P0DP23 149 aa27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CALM2P0DP24 149 aa27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CALM3P0DP25 149 aa27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.19■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 GUCY1A2P33402 732 aa27.18■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 NFIAQ12857 509 aa27.18■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 SOGA3Q5TF21 947 aa27.18■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 ZNF287Q9HBT7 754 aa27.18■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 FSD2A1L4K1 749 aa27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 TSPY3P0CV98 308 aa27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 TSPY8P0CW00 308 aa27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 KRT40Q6A162 431 aa27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 LARGE2Q8N3Y3 721 aa27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP27.17■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 KIF28PB7ZC32 967 aa27.16■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP27.16■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 NEDD1Q8NHV4 660 aa27.16■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CCDC178Q5BJE1 867 aa27.16■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 PLEKHA8P1O95397 391 aa27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 TRIM22Q8IYM9 498 aa27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 CCDC82Q8N4S0 544 aa27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 GMLQ99445 158 aa27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 IDI2Q9BXS1 227 aa27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 DEXIO95424 95 aa27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 VIL1P09327 827 aaKnown RBP27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 PTGER2P43116 358 aa27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 TMTC3Q6ZXV5 915 aa27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 ZFPM1Q8IX07 1006 aa27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 SPATA32Q96LK8 384 aa27.14■■□□□ 1.94
DGCR6-208ENST00000608842 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.14■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 PLIN4Q96Q06 1357 aa27.14■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 NOVP48745 357 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 ATL3Q6DD88 541 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 WASF1Q92558 559 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 USP28Q96RU2 1077 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 FAM198AQ9UFP1 575 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 CFAP45Q9UL16 551 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 MYO3BQ8WXR4 1341 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 PSMD14O00487 310 aa27.13■■□□□ 1.93
DGCR6-208ENST00000608842 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms