RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 GDF11O95390 407 aa20.37■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 ASNSP08243 561 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 PTPRAP18433 802 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 MAP2K2P36507 400 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 JAG1P78504 1218 aa20.37■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 OTUD5Q96G74 571 aa20.37■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 PPIL2Q13356 520 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 ABCB5Q2M3G0 1257 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 ZIC5Q96T25 663 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF287Q9HBT7 754 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 CTNNA3Q9UI47 895 aa20.36■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa20.36■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 PTH1RQ03431 593 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 STK11IPQ8N1F8 1099 aa20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 ZHX2Q9Y6X8 837 aa20.35■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L5A8MUK1 530 aa20.34■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 CTDSPL2Q05D32 466 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 PDE4BQ07343 736 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 TBC1D2Q9BYX2 928 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 MKNK2Q9HBH9 465 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 CABP5Q9NP86 173 aa20.34■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 THSD7BQ9C0I4 1608 aa20.34■□□□□ 0.85
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RABGGTA-203ENST00000543002 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 JMYQ8N9B5 988 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 MAP4K1Q92918 833 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 KCNH4Q9UQ05 1017 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-203ENST00000543002 FGRP09769 529 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 AKR1B1P15121 316 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 GTF2A2P52657 109 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 HAND2P61296 217 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 MS4A4AQ96JQ5 239 aa20.32■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
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RABGGTA-203ENST00000543002 WDR18Q9BV38 432 aa20.31■□□□□ 0.84
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RABGGTA-203ENST00000543002 ANO2Q9NQ90 1003 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 TACC3Q9Y6A5 838 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 MYH8P13535 1937 aa20.31■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 ORC4O43929 436 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 PCP11498 1178 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 TM4SF4P48230 202 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 SREBF2Q12772 1141 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 SEPT2Q15019 361 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 RAB3GAP1Q15042 981 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 INCENPQ9NQS7 918 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 PHIPQ8WWQ0 1821 aa20.3■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 CETPP11597 493 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 SPP2Q13103 211 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 AKNAD1Q5T1N1 836 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 TBC1D10CQ8IV04 446 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 STAG1Q8WVM7 1258 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 LAMA4Q16363 1823 aa20.29■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 TRIM75PA6NK02 468 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 CCL15Q16663 113 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 MFSD6Q6ZSS7 791 aa20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP20.28■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 BRI3BPQ8WY22 251 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 KANSL2Q9H9L4 492 aa20.27■□□□□ 0.84
RABGGTA-203ENST00000543002 CYP21A2P08686 494 aa20.27■□□□□ 0.83
RABGGTA-203ENST00000543002 TFAP4Q01664 338 aa20.27■□□□□ 0.83
RABGGTA-203ENST00000543002 NEDD1Q8NHV4 660 aa20.27■□□□□ 0.83
RABGGTA-203ENST00000543002 TOMM22Q9NS69 142 aa20.27■□□□□ 0.83
RABGGTA-203ENST00000543002 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-203ENST00000543002 C19orf81C9J6K1 198 aa20.26■□□□□ 0.83
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L10C9JJH3 530 aa20.26■□□□□ 0.83
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