RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 PANK1Q8TE04 598 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 H0YGN5 161 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 GDF11O95390 407 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.45■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC6Q86TZ1 520 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 MAST2Q6P0Q8 1798 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB118Q96PH6 123 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 NR2E3Q9Y5X4 410 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 HMMRO75330 724 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC18Q9H819 358 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L2Q6R6M4 530 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 ANTXR1Q9H6X2 564 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 MORF4L1Q9UBU8 362 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 SERPINB13Q9UIV8 391 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 JAG1P78504 1218 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 FEZ1Q99689 392 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 BCL11AQ9H165 835 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 CABP5Q9NP86 173 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 CENPFP49454 3210 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-220ENST00000511663 APBB1O00213 710 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 GH2P01242 217 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 HMGCRP04035 888 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 HERVK_113P62684 666 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 LOC285556D6RIA3 1793 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 PDE3AQ14432 1141 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 TATDN1Q6P1N9 297 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 NUDT12Q9BQG2 462 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 EHD4Q9H223 541 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 GJD2Q9UKL4 321 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPK4P31152 587 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP14P54578 494 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.332e-7■■■■□ 26.2
SH3BP2-220ENST00000511663 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 RPTORQ8N122 1335 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 EVI5O60447 810 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB11FIP3O75154 756 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2B6P20813 491 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CHRDL2Q6WN34 429 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 EMILIN3Q9NT22 766 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 NECAB2Q7Z6G3 386 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SOCS4Q8WXH5 440 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 COG6Q9Y2V7 657 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 FOCADQ5VW36 1801 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 SIPA1L1O43166 1804 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L15C9J2P7 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L13C9JLJ4 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L11C9JVI0 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L18D6R9N7 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L22D6RA61 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L17D6RBQ6 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L19D6RCP7 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L20D6RJB6 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L24Q0WX57 530 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 GOLIM4O00461 696 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVK-9P63128 1117 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 ERVK-24P63145 666 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 CCNA1P78396 465 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKLE1Q8NAG6 615 aa23.33■■□□□ 1.33
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