RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503080.1

UBE2B-203, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-203ENST00000503080 FAM221AA4D161 298 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 GNAT3A8MTJ3 354 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 CILPO75339 1184 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 BPNT1O95861 308 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 F13A1P00488 732 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 PDE4BQ07343 736 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 SNX11Q9Y5W9 270 aa7.31□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 PLCL1Q15111 1095 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 NKPD1Q17RQ9 610 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM87BQ96K49 555 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 BCL11AQ9H165 835 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 COPRSQ9NQ92 184 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 KBTBD4Q9NVX7 518 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.3□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 SLC6A19Q695T7 634 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 CBLL1Q75N03 491 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 ERMP1Q7Z2K6 904 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 ADAM30Q9UKF2 790 aa7.29□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 PRR33A8MZF0 331 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 PLCG1P19174 1290 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 CDH24Q86UP0 819 aa7.28□□□□□ -1.24
UBE2B-203ENST00000503080 FUT4P22083 530 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 GARTP22102 1010 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ASB11Q8WXH4 323 aa7.27□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 UPK3BL1B0FP48 263 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 UPK3BL2E5RIL1 263 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 PAX4O43316 350 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CBX7O95931 251 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CYP7A1P22680 504 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 MFSD4AQ8N468 514 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 FBXO27Q8NI29 283 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 GGT7Q9UJ14 662 aa7.26□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 GRIN3BO60391 1043 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CLCN7P51798 805 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 MPP2Q14168 576 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM201Q5SNT2 666 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CDKAL1Q5VV42 579 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 C22orf34Q6ZV56 151 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 REC114Q7Z4M0 266 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 TMEM87AQ8NBN3 555 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 FAM13CQ8NE31 585 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 PI4K2BQ8TCG2 481 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 HSPA12BQ96MM6 686 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa7.25□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 YARSP54577 528 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 IKZF1Q13422 519 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 REV1Q9UBZ9 1251 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 PRR36Q9H6K5 1346 aa7.24□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 H3BS24 57 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 HTR3BO95264 441 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 LDLRAD1Q5T700 205 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 PRDM7Q9NQW5 492 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 SEMA3GQ9NS98 782 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 GREM1O60565 184 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ETV3P41162 512 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 KIR3DL1P43629 444 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 ZP2Q05996 745 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-203ENST00000503080 BACH2Q9BYV9 841 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms