RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497842.6

TTC19-208, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 19, human

TSL 5

Gene TTC19, Length 1,360 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC19-208	ENST00000497842	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	33.63	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		33.63	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	PRC1	O43663	620 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TBC1D12	O60347	775 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	RASA1	P20936	1047 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	33.62	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CREBZF	Q9NS37	354 aa		33.62	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TSPY2	A6NKD2	308 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	SHMT1	P34896	483 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		33.61	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	POTEI	P0CG38	1075 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	POTEJ	P0CG39	1038 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	FGD1	P98174	961 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	DNAJC18	Q9H819	358 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	FAM196B	A6NMK8	535 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TSPY3	P0CV98	308 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TSPY8	P0CW00	308 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TFAP4	Q01664	338 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	DCAF15	Q66K64	600 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CHST3	Q7LGC8	479 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	IQCA1	Q86XH1	822 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC17	Q96LX7	622 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TTC14	Q96N46	770 aa		33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	ALDH8A1	Q9H2A2	487 aa	Predicted RBP	33.6	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	ANTXR2	P58335	489 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	MAP3K10	Q02779	954 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	LDHD	Q86WU2	507 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM87B	Q96K49	555 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	MTA3	Q9BTC8	594 aa		33.59	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	ADM5	C9JUS6	153 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	ANKRD1	Q15327	319 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	33.58	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	CDC37L1	Q7L3B6	337 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		33.58	■■■□□ 2.97
TTC19-208	ENST00000497842		Q6ZUG5	572 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	USP48	Q86UV5	1035 aa		33.57	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ERICH2	A1L162	156 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	SLURP2	P0DP57	97 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	MCM2	P49736	904 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		33.56	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	33.55	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	AK2	P54819	239 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	FBXL16	Q8N461	479 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	SNX21	Q969T3	373 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		33.55	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM67	Q5HYA8	995 aa		33.54	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	33.54	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	AKR1B1	P15121	316 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	33.53	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	33.52	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	NF2	P35240	595 aa		33.52	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	HSCB	Q8IWL3	235 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	CDCA5	Q96FF9	252 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	AGXT2	Q9BYV1	514 aa		33.51	■■■□□ 2.96
TTC19-208	ENST00000497842	TNKS	O95271	1327 aa		33.51	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	WTAP	Q15007	396 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	33.5	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	TMTC2	Q8N394	836 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	CABP5	Q9NP86	173 aa		33.5	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	BECN1	Q14457	450 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	PPP4R3B	Q5MIZ7	849 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	BRF1	Q92994	677 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	SSC5D	A1L4H1	1573 aa		33.49	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	FOXN1	O15353	648 aa		33.48	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	CD2BP2	O95400	341 aa	Known RBP	33.48	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	LIFR	P42702	1097 aa		33.48	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	33.48	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		33.48	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	PASK	Q96RG2	1323 aa		33.48	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	GDF11	O95390	407 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	SEC23A	Q15436	765 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	LY9	Q9HBG7	655 aa		33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	33.47	■■■□□ 2.95
TTC19-208	ENST00000497842	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		33.47	■■■□□ 2.95

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