RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481935.5

ABCD4-211, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 5

Gene ABCD4, Length 2,336 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-211ENST00000481935 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 ARMT1Q9H993 441 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 ZNF75DP51815 510 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 STK3Q13188 491 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 Q6ZUG5 572 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 PDCL2Q8N4E4 241 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 AIDAQ96BJ3 306 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 CTNNA3Q9UI47 895 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 CFAP45Q9UL16 551 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 DENND2AQ9ULE3 1009 aa14.72□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 ZNF165P49910 485 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 DMTNQ08495 405 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 LCORLQ8N3X6 602 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 AGXT2Q9BYV1 514 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 NBPF3Q9H094 633 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 CLRN2A0PK11 232 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 WNT10BO00744 389 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 PRKAB2O43741 272 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 ANKRD7Q92527 254 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 RAI14Q9P0K7 980 aa14.71□□□□□ -0.05
ABCD4-211ENST00000481935 H3BQV1 296 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 TRAF5O00463 557 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 NR1I2O75469 434 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 APPP05067 770 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CFAP100Q494V2 611 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 IFFO2Q5TF58 517 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CHST3Q7LGC8 479 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CHMP4CQ96CF2 233 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CDC25BP30305 580 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CACNB3P54284 484 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 RESTQ13127 1097 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 SYCP1Q15431 976 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 FBXL16Q8N461 479 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 WDR66Q8TBY9 1149 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PGBD1Q96JS3 809 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 GGA3Q9NZ52 723 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 MYH2Q9UKX2 1941 aa14.7□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CTAGE5O15320 804 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PFKFB2O60825 505 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 TOMM70O94826 608 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 LDHBP07195 334 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CYP7A1P22680 504 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 BRF1Q92994 677 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 MYO3BQ8WXR4 1341 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 SMTNL1A8MU46 457 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CRKP46108 304 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 HTRA3P83110 453 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CLIP2Q9UDT6 1046 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.69□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 GSG1L2A8MUP6 293 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 SEMA3EO15041 775 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 DLGAP5Q15398 846 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 DNAJC25Q9H1X3 360 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 HDAC9Q9UKV0 1011 aa14.68□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 ADM5C9JUS6 153 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 JAK2O60674 1132 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 FGD1P98174 961 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 MECOMQ03112 1051 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 ZNF213O14771 459 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 NEMFO60524 1076 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 SARM1Q6SZW1 724 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 LDHDQ86WU2 507 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 VEZTQ9HBM0 779 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 INCENPQ9NQS7 918 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 NRBP1Q9UHY1 535 aa14.67□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 TNNT1P13805 278 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 CBX1P83916 185 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 LRMPQ12912 555 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 ATL3Q6DD88 541 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 IFNL3Q8IZI9 196 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 SDR42E1Q8WUS8 393 aa14.66□□□□□ -0.06
ABCD4-211ENST00000481935 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 126 ms