RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361125.1

SMURF1-201, Transcript of SMAD specific E3 ubiquitin protein ligase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMURF1, Length 5,737 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMURF1-201ENST00000361125 SUPT20HQ8NEM7 779 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 OPA1O60313 960 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PROSER3Q2NL68 480 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC77Q9BR77 488 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 USP17L12C9JPN9 530 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 USP17L21D6R901 530 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 KIF4AO95239 1232 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 VPS18Q9P253 973 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PPIP5K2O43314 1243 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 KRT9P35527 623 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PPP1R2P41236 205 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 POSTNQ15063 836 aa23.56■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 EVCP57679 992 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CABP7Q86V35 215 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 MSANTD4Q8NCY6 345 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 KIFC2Q96AC6 838 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 IFNL3Q8IZI9 196 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CAPN2P17655 700 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TNFAIP3P21580 790 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 LRRC45Q96CN5 670 aa23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 FERP16591 822 aa23.55■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 NELFCDQ8IXH7 590 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 NIM1KQ8IY84 436 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TAB2Q9NYJ8 693 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PNOCQ13519 176 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ATP2A1O14983 1001 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TICAM2Q86XR7 235 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CCDC63Q8NA47 563 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 CHAMP1Q96JM3 812 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 STRN3Q13033 797 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ASIC2Q16515 512 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 NSMFQ6X4W1 530 aa23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TUBB4BP68371 445 aa23.53■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 LONRF3Q496Y0 759 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ATRIPQ8WXE1 791 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 GLT8D2Q9H1C3 349 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23.53■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 MYCT1Q8N699 235 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa23.53■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TTC37Q6PGP7 1564 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 SEL1L2Q5TEA6 688 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 HAUS7Q99871 368 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 NOP56O00567 594 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 SCNN1DP51172 638 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 DNM3Q9UQ16 869 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 KIFAP3Q92845 792 aa23.52■■□□□ 1.36
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SMURF1-201ENST00000361125 GINS2Q9Y248 185 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 SMCO2A6NFE2 343 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 ELF2Q15723 593 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 PDE6AP16499 860 aa23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SMURF1-201ENST00000361125 RGS12O14924 1447 aa23.52■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TRIM14Q14142 442 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MLKLQ8NB16 471 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 SERTAD1Q9UHV2 236 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 CETN3O15182 167 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 USPL1Q5W0Q7 1092 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 ASAP1Q9ULH1 1129 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TLDC2A0PJX2 215 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 PDE6BP35913 854 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TNNC1P63316 161 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 TPCN1Q9ULQ1 816 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SMURF1-201ENST00000361125 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
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