RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000225308.12

SLC25A39-201, Transcript of solute carrier family 25 member 39, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLC25A39, Length 1,607 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A39-201ENST00000225308 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 PICK1Q9NRD5 415 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 LAMA4Q16363 1823 aa25.97■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 ZMYM6O95789 1325 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 FGAP02671 866 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 SWAP70Q9UH65 585 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 IRF6O14896 467 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 PPATQ06203 517 aa25.96■■□□□ 1.75
SLC25A39-201ENST00000225308 SGSM2O43147 1006 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 CDK8P49336 464 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 PPIL2Q13356 520 aa25.95■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 ASNSP08243 561 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa25.94■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 PPARAQ07869 468 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 MS4A4AQ96JQ5 239 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 ZHX2Q9Y6X8 837 aa25.93■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 GH2P01242 217 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 STK11IPQ8N1F8 1099 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 GINM1Q9NU53 330 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 KCNH4Q9UQ05 1017 aa25.92■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 ABCB5Q2M3G0 1257 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa25.91■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 CDC45O75419 566 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa25.9■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 USP17L5A8MUK1 530 aa25.89■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 GTF2A2P52657 109 aa25.89■■□□□ 1.74
SLC25A39-201ENST00000225308 AKR1B1P15121 316 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 RASA1P20936 1047 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 GUCY1A2P33402 732 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TM4SF4P48230 202 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CTDSPL2Q05D32 466 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 SNAPC2Q13487 334 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 WBP1LQ9NX94 342 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 PRDM1O75626 825 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 PTH1RQ03431 593 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 SREBF2Q12772 1141 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 BRI3BPQ8WY22 251 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CCDC17Q96LX7 622 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 NBPF3Q9H094 633 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TACC3Q9Y6A5 838 aa25.88■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TRIM75PA6NK02 468 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CXCL11O14625 94 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 HAND2P61296 217 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 MKNK2Q9HBH9 465 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CABP5Q9NP86 173 aa25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.87■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 INHBEP58166 350 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 SPP2Q13103 211 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 SEPT2Q15019 361 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 RAB3GAP1Q15042 981 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CCL15Q16663 113 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 PTPN18Q99952 460 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 WDR18Q9BV38 432 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D2Q9BYX2 928 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF287Q9HBT7 754 aa25.86■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.731e-7■■■■□ 22.7
SLC25A39-201ENST00000225308 PDE4BQ07343 736 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TMEM179Q6ZVK1 233 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 INCENPQ9NQS7 918 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 FGRP09769 529 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CETPP11597 493 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 MOGSQ13724 837 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CASC1Q6TDU7 716 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 AS3MTQ9HBK9 375 aa25.85■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 IFNL1Q8IU54 200 aa25.84■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CLEC10AQ8IUN9 316 aa25.84■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP25.84■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 TBC1D10CQ8IV04 446 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 MAP4K1Q92918 833 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.83■■□□□ 1.73
SLC25A39-201ENST00000225308 MYH4Q9Y623 1939 aa25.82■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ZNF213O14771 459 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 ORC4O43929 436 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 MTMR2Q13614 643 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 PLIN4Q96Q06 1357 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 HMGCS2P54868 508 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 BACE1P56817 501 aa25.81■■□□□ 1.72
SLC25A39-201ENST00000225308 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
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