RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000034876.9

Tspan3-201, Transcript of Tetraspanin-3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Tspan3, Length 1,716 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmc4Q7TQ65 694 aa29.86■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ubac1Q8VDI7 409 aa29.86■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mad2l2Q9D752 211 aa29.86■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc178Q8CDV0 866 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Akap8Q9DBR0 687 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem47Q9JJG6 181 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CnpP16330 420 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CgnP59242 1191 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gxylt1Q3UHH8 404 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Scnn1aQ61180 699 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tacc1Q6Y685 774 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Acnat2Q8BGG9 420 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 PaoxQ8C0L6 504 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rbm28Q8CGC6 750 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Atxn7Q8R4I1 867 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stk39Q9Z1W9 556 aa29.85■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zscan20B2KFW1 1030 aa29.84■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc27a3O88561 667 aa29.84■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dpp8Q80YA7 892 aa29.84■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 A0A1Y7VML8 143 aa29.83■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 En2P09066 324 aa29.83■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Dnm1P39053 867 aa29.83■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Usp5P56399 858 aaKnown RBP29.83■■■□□ 2.37
Tspan3-201ENSMUST00000034876 ArsiQ32KI9 573 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Triml1Q8BVP1 470 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ptrh1Q8BW00 204 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Krt85Q9Z2T6 507 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccp110Q7TSH4 1004 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Glipr1l2Q9CQ35 332 aa29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Eif4enif1Q9EST3 983 aaKnown RBP29.82■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Alppl2P24823 529 aa29.81■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ube2hP62257 183 aa29.81■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmx3Q8BXZ1 456 aa29.81■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ppp1r11Q8K1L5 131 aa29.81■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccng2O08918 344 aa29.8■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP29.8■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Borcs6Q9D6W8 360 aa29.8■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Col1a1P11087 1453 aa29.8■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Glt1d1A4FUP9 346 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 D1Pas1P16381 660 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tbc1d9bQ5SVR0 1263 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Fam196bQ6GQV1 535 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Evc2Q8K1G2 1220 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tmem79Q9D709 391 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Trmt112Q9DCG9 125 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Map9Q3TRR0 646 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc93Q7TQK5 629 aa29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nup88Q8CEC0 753 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Bcorl1A2AQH4 1781 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Stag2O35638 1231 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ubxn2bQ0KL01 331 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Naa30Q8CES0 364 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Kcnj14Q8JZN3 434 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mtmr3Q8K296 1196 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mtmr4Q91XS1 1190 aa29.78■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 TicrrQ8BQ33 1889 aa29.77■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 A430078G23RikE9Q7Y4 484 aa29.77■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Lnx1O70263 728 aa29.77■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Srek1Q8BZX4 494 aaKnown RBP29.77■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cplx1P63040 134 aa29.76■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Thrap3Q569Z6 951 aaKnown RBP29.76■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zbtb22Q9Z0G7 638 aa29.76■■■□□ 2.36
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Mageb2A2AHM0 380 aa29.76■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 FktnQ8R507 461 aa29.76■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tob2Q9JM55 345 aa29.76■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gm9992B2RWK3 458 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Glra4Q61603 456 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ces3aQ63880 571 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Unc93aQ710D3 458 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ces3bQ8VCU1 571 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gpaa1Q9WTK3 621 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Col2a1P28481 1487 aa29.75■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Eif6O55135 245 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ncf1Q09014 390 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Usp28Q5I043 1051 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Slc27a1Q60714 646 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Zbtb39Q6PDK0 712 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Nop2Q922K7 793 aaKnown RBP29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Pde4aO89084 844 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 GnaqP21279 359 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ift74Q8BKE9 600 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Styxl1Q9DAR2 321 aa29.74■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Myh8P13542 1937 aa29.73■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Magea1O89006 320 aa29.73■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Magea5O89009 320 aa29.73■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Tjap1Q9DCD5 539 aa29.73■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Magea2Q9R2A2 320 aa29.73■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Prss51A0A286YDY8 319 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Cyp3a25O09158 503 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 U2af2P26369 475 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 CebpaP53566 359 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 MycbpapQ5SUV2 932 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Prkag3Q8BGM7 489 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Gjd4Q8BSD4 364 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Sec62Q8BU14 398 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Wdr24Q8CFJ9 790 aa29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rbm19Q8R3C6 952 aaKnown RBP29.72■■■□□ 2.35
Tspan3-201ENSMUST00000034876 Rnaseh2aQ9CWY8 301 aa29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 52.8 ms