RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000030660.8

Trappc3-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cdk8Q8R3L8 464 aa20.57■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Plekha4Q8VC98 588 aa20.57■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Tomm22Q9CPQ3 142 aa20.57■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mbd3Q9Z2D8 285 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ano3A2AHL1 981 aa20.56■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Abl1P00520 1123 aa20.56■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gnat2P50149 354 aa20.56■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Eme2Q56A04 373 aa20.56■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 SkilQ60665 675 aa20.56■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 ArxO35085 564 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Igfbp4P47879 254 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 CalcaP70160 136 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 PrkczQ02956 592 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Vta1Q9CR26 309 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gcc1Q9D4H2 778 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Usp14Q9JMA1 493 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Znhit2Q9QY66 399 aa20.55■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Trim5E9PV98 497 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sema3fO88632 785 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mybl2P48972 704 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Csrnp3P59055 597 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 GclcP97494 637 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ccdc27Q3V036 639 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Bmp2kQ91Z96 1138 aa20.54■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rexo5D3YW29 759 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fads2p1Q0VAX3 487 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rad50P70388 1312 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fgfr2P21803 821 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Hoxd10P28359 340 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Wdr70Q3TWF6 657 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Acap3Q6NXL5 833 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Aoc2Q812C9 757 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ift74Q8BKE9 600 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ndufv1Q91YT0 464 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pcgf6Q99NA9 353 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rgs19Q9CX84 216 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Styxl1Q9DAR2 321 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Spint1Q9R097 507 aa20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Pdcd6ipQ9WU78 869 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa20.52■□□□□ 0.88
Trappc3-201ENSMUST00000030660 A0A1W2P6Q8 802 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gm9048A0A1W2P7H4 802 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 A0A1W2P7Z8 802 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Gm9046A0A1W2P855 802 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 NapbP28663 298 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sp4Q62445 782 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cgnl1Q6AW69 1298 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Tex2Q6ZPJ0 1128 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ubap2lQ80X50 1107 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fam205cQ80YD3 371 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mb21d2Q8C525 428 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Tdrd1Q99MV1 1172 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Prkab1Q9R078 270 aa20.52■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 FAM186AQ9D9R9 1790 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Dennd3A2RT67 1274 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Mdm2P23804 489 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Morf4l1P60762 362 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 MyrflQ3UN70 904 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Olfr118Q7TRJ6 321 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Znf784Q8BI69 297 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Itgbl1Q8VDV0 494 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Bap1Q99PU7 728 aa20.51■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rc3h1Q4VGL6 1130 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sgpl1Q8R0X7 568 aa20.5■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 IrgqQ8VIM9 583 aa20.5■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Eid1Q9DCR4 169 aa20.5■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Efcc1Q9JJF6 558 aa20.5■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 MyocO70624 490 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Eya3P97480 510 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Srrm1Q52KI8 946 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Fam170aQ66LM6 333 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Prkag2Q91WG5 566 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Srgap1Q91Z69 1062 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 HlcsQ920N2 722 aa20.49■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Zkscan2G3X952 960 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Nck2O55033 380 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 YdjcQ14BV6 310 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Hs1bp3Q3TC93 395 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Btg1-ps1Q3V0S2 161 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Btg1-ps2Q3V0X0 161 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Ttc12Q8BW49 704 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 AidaQ8C4Q6 305 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Erc1Q99MI1 1120 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Bco2Q99NF1 532 aa20.48■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Atp8b3Q6UQ17 1335 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Nf2P46662 596 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rgl2Q61193 778 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 ShbQ6PD21 503 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Lrch3Q8BVU0 778 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Defb15Q8R2I5 79 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Sapcd2Q9D818 391 aa20.47■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Dock2Q8C3J5 1828 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cyp2c37P56654 490 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Rnf157Q3TEL6 685 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Zbtb39Q6PDK0 712 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cyp2c54Q6XVG2 490 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Adam1bQ8R534 806 aa20.46■□□□□ 0.87
Trappc3-201ENSMUST00000030660 Cyp2c50Q91X77 490 aa20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 87.3 ms