RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ltn1Q6A009 1767 aa-0.51□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defb14Q7TNV9 67 aa-0.51□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 ShprhQ7TPQ3 1674 aa-0.51□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Abca3Q8R420 1704 aa-0.51□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa-0.51□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PplQ9R269 1755 aa-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lama3Q61789 3330 aa-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ttc37F8VPK0 1563 aa-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm20661K7N787 53 aa-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hmgn1P18608 96 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP-0.52□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Abca9Q8K449 1623 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 LystP97412 3788 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NktrP30415 1453 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm20537G3UYK7 97 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hmga1P17095 107 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SnrpfP62307 86 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ndufc1Q9CQY9 76 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Arhgef28P97433 1693 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP-0.53□□□□□ -2.49
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A2mQ6GQT1 1474 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ubr3Q5U430 1889 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Birc6O88738 4882 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Krtap22-2J3QNX6 67 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Phxr2P15972 65 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmsb15lQ8C0W0 80 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrpl36Q99N90 102 aa-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Eif4g3Q80XI3 1579 aaKnown RBP-0.54□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tln1P26039 2541 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ryr1E9PZQ0 5035 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wnk3Q80XP9 1757 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Als2Q920R0 1651 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Usp9xP70398 2559 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A0A286YE49 62 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Morn2Q6UL01 79 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Csmd1Q923L3 3564 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hfm1D3Z4R1 1434 aa-0.55□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kif14L0N7N1 1674 aaKnown RBP-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kif21aQ9QXL2 1672 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 LrbaQ9ESE1 2856 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pik3c2gO70167 1506 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Scn11aQ9R053 1765 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 FryE9Q8I9 3020 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 RictorQ6QI06 1708 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pola1P33609 1465 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Qser1A2BIE1 1698 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Naip5Q9R016 1403 aa-0.56□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ino80Q6ZPV2 1559 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Talpid3E9PV87 1520 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm14288E9Q9W0 88 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mt2P02798 61 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cox8bP48772 70 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Itgb3bpQ9CQ82 176 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cep290Q6A078 2472 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dnah3Q8BW94 4083 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pkd1O08852 4293 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 UacaQ8CGB3 1411 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cpsf1Q9EPU4 1441 aaKnown RBP-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PappaQ8R4K8 1624 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa-0.57□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dnah6E9Q0B6 4144 aa-0.58□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kiaa0556Q8C753 1610 aa-0.58□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kif20bQ80WE4 1774 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Piezo2Q8CD54 2822 aa-0.58□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nhsl1Q8CAF4 1587 aa-0.58□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PrkdcP97313 4128 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ncoa2Q61026 1462 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam208aQ69ZR9 1610 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 KantrA0A1W2P7I0 76 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10130F6ZHM5 101 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Higd1bQ99JY6 98 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrpl33Q9CQP0 65 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CubnQ9JLB4 3623 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Csmd2V9GX34 3611 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 HydinQ80W93 5154 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dnah10D3YYQ8 4591 aa-0.59□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 FAM186AQ9D9R9 1790 aa-0.6□□□□□ -2.5
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A730009L09RikA0A1B0GS82 72 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 S100zB9EJL3 99 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q91WE4 72 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Myo9aQ8C170 2542 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Plch2A2AP18 1501 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rev3lQ61493 3122 aa-0.6□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Baz1aO88379 1555 aa-0.61□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa-0.61□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Itsn2Q9Z0R6 1659 aa-0.61□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Defa17Q64016 82 aa-0.61□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Efcab10Q9D581 132 aa-0.61□□□□□ -2.51
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Abcc1O35379 1528 aa-0.61□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 70.2 ms