RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044155.14

Ubash3b-201, Transcript of Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ubash3b, Length 6,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm9507D3Z5T3 223 aa9.32□□□□□ -0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myo18bE9PV66 2605 aa9.3□□□□□ -0.92
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ankrd11E9Q4F7 2643 aa9.27□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cystm1Q8K353 104 aa9.27□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AtrQ9JKK8 2635 aa9.26□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mki67E9PVX6 3177 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gcn1E9PVA8 2671 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm37013Q8K491 104 aa9.22□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rev3lQ61493 3122 aa9.22□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Usp24B1AY13 2617 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cdh23Q99PF4 3354 aa9.21□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap29-1A2A5X4 342 aa9.19□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fam229aB2KGE5 128 aa9.18□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap10-4Q08EG8 221 aa9.18□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap13O88375 197 aa9.18□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm16253D3Z167 63 aa9.16□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FlnbQ80X90 2602 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lama2Q60675 3118 aaKnown RBP9.16□□□□□ -0.94
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Hectd1Q69ZR2 2618 aaKnown RBP9.14□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 A730071L15RikQ8C4X0 137 aa9.14□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Camk2n1Q6QWF9 78 aa9.12□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HttP42859 3119 aa9.1□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa9.1□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Prrc2cQ3TLH4 2846 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chd7A2AJK6 2986 aaKnown RBP9.09□□□□□ -0.95
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ranbp2Q9ERU9 3053 aaKnown RBP9.08□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa9.07□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa9.06□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Sec61bQ9CQS8 96 aaKnown RBP9.06□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa9.06□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 HrnrQ8VHD8 2496 aa9.05□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FasnP19096 2504 aaKnown RBP9.02□□□□□ -0.96
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 MgaA2AWL7 3003 aaKnown RBP8.97□□□□□ -0.97
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fn1P11276 2477 aaKnown RBP8.96□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dmxl1Q6PNC0 3013 aa8.93□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnrc18Q80WC3 2878 aa8.93□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Szt2A2A9C3 3431 aa8.92□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stab1Q8R4Y4 2571 aa8.92□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Krtap14O08640 167 aa8.91□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm19426M0QWC7 77 aa8.91□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm3646F6S692 53 aa8.91□□□□□ -0.98
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 2310061N02RikQ9D6S9 174 aa8.87□□□□□ -0.99
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ash1lQ99MY8 2958 aa8.87□□□□□ -0.99
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Notch1Q01705 2531 aa8.85□□□□□ -0.99
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Unc80Q8BLN6 3261 aa8.85□□□□□ -0.99
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rpl37Q9D823 97 aa8.84□□□□□ -0.99
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BC029722A0A0N4SW31 51 aa8.83□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Zfhx3Q61329 3726 aa8.82□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Fbn2Q61555 2907 aa8.82□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm2696A0A1W2P709 240 aa8.81□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Romo1P60603 79 aa8.81□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Map1aQ9QYR6 2776 aa8.81□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cfap54Q8C6S9 3106 aa8.8□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Vps13aQ5H8C4 3166 aa8.8□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Itpr3P70227 2670 aa8.8□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myo15bI7HPW8 3033 aa8.79□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Celsr3Q91ZI0 3301 aa8.78□□□□□ -1
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Akap13E9Q394 2776 aa8.76□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Itpr1P11881 2749 aa8.76□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Mast4Q811L6 2618 aa8.76□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AtmQ62388 3066 aa8.75□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 KalrnA2CG49 2964 aa8.75□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 BptfA2A654 3036 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm10382Q3V0T5 144 aa8.72□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm2310J3QNJ2 377 aa8.71□□□□□ -1.01
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tnp2P11378 117 aa8.7□□□□□ -1.02
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Chd6A3KFM7 2711 aa8.69□□□□□ -1.02
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 NipblQ6KCD5 2798 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Igsf10Q3V1M1 2594 aa8.66□□□□□ -1.02
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Celsr1O35161 3034 aa8.64□□□□□ -1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Ubr5Q80TP3 2792 aa8.61□□□□□ -1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lrrc37aB1AWG4 3215 aa8.6□□□□□ -1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Frem2Q6NVD0 3160 aa8.6□□□□□ -1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 4933415A04RikQ9D443 101 aa8.59□□□□□ -1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa8.59□□□□□ -1.03
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Rps29P62274 56 aa8.58□□□□□ -1.04
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Tep1P97499 2629 aa8.58□□□□□ -1.04
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Brca2P97929 3329 aa8.57□□□□□ -1.04
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 AspmQ8CJ27 3122 aa8.56□□□□□ -1.04
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 2310057N15RikQ9D6T8 200 aa8.5□□□□□ -1.05
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Cox6b2Q80ZN9 88 aa8.49□□□□□ -1.05
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 9530053A07RikE9PVG8 2581 aa8.48□□□□□ -1.05
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm5965D3Z724 196 aa8.47□□□□□ -1.05
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Kmt2bO08550 2713 aa8.47□□□□□ -1.05
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 1700042G07RikB1AUF7 90 aa8.44□□□□□ -1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Col6a3E9PWQ3 3284 aa8.44□□□□□ -1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FrylF8VQ05 3007 aa8.44□□□□□ -1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Adgrg4B7ZCC9 3073 aa8.42□□□□□ -1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa8.42□□□□□ -1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Muc2Q80Z19 2680 aa8.4□□□□□ -1.06
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Lama1P19137 3084 aa8.4□□□□□ -1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Wdfy4E9Q2M9 3149 aa8.39□□□□□ -1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Utp20Q5XG71 2788 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 FryE9Q8I9 3020 aa8.38□□□□□ -1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Itpr2Q9Z329 2701 aa8.37□□□□□ -1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Stab2Q8R4U0 2559 aa8.36□□□□□ -1.07
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Gm21887J3QQ04 176 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Myo15aQ9QZZ4 3511 aa8.33□□□□□ -1.08
Ubash3b-201ENSMUST00000044155 Dchs2A0A0A6YW72 3346 aa8.32□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 90.7 ms