RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227089.1

Ankrd28-204, Transcript of Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, mousemouse

BASIC

Gene Ankrd28, Length 3,522 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tex15F8VPN2 2785 aa3.49□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01750 117 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mrps21P58059 87 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Synj2bpQ9D6K5 145 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 HampQ9EQ21 83 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ankrd17Q99NH0 2603 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-82A0A0G2JEU7 117 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Psmb8P28063 276 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cfap126Q6P8X9 189 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Q9CX25 107 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Hist1h4aP62806 103 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mob4Q6PEB6 225 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 4930442H23RikQ9D5G7 103 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa3.48□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-50A0A075B5W1 117 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-64A0A075B5X3 117 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 1700056E22RikF7CNM6 234 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01643 108 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P01753 117 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Polr2kQ63871 58 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lelp1Q9DAE3 120 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv3-1A0A075B5S6 116 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-52A0A0A6YXC3 117 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-57A0A0A6YYE7 117 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-71A0A0G2JEH0 117 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igf1P05017 153 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ifitm1Q9D103 106 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ndufa11Q9D8B4 141 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Spry2Q9QXV8 315 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tenm3Q9WTS6 2715 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv6-13A0A0G2JGY3 119 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Znf575Q3TXZ1 239 aa3.47□□□□□ -1.85
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-75A0A075B5Y2 117 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-59A0A0B4J1I8 117 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm7849D3YX03 116 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 6430550D23RikE9Q1X6 194 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm7102J3QQ10 178 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 SelenowP63300 88 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Brk1Q91VR8 75 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ndufb4Q9CQC7 129 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trbv16A0A0B4J1H3 115 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 C1qcQ02105 246 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Spink12Q9D256 87 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ndufs7Q9DC70 224 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa3.46□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm11213A0A1B0GR83 88 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Tmem243B2RVB9 118 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Defa28D3Z1V9 94 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Usmg5Q78IK2 58 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pfn2Q9JJV2 140 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Spink1P09036 80 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Apoc4Q61268 124 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Defb29Q8BGW9 78 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Hivep1Q03172 2688 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-85A0A075B5Y6 117 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-12A0A0A6YXJ9 117 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Lst1O08843 95 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 AngP21570 145 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 P84751 237 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 AtrQ9JKK8 2635 aa3.45□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trdv5A0A075B661 115 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv3-3A0A0A6YWL2 116 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm16381A0A1Y7VKT9 73 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prm2P07978 107 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Vpreb1P13372 142 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv1-66A0A075B5X5 117 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv4-70A0A0B4J1I5 116 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav9d-4A0A0G2JG37 103 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 LhbO09108 141 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Cela2aP05208 271 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gphb5Q812B2 130 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ly6hQ9WUC3 139 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 9430015G10RikA2ASP7 199 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm9970F6ZED4 185 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Edn3P48299 214 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 CenpwQ3URR0 86 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Odf1Q61999 247 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ndufa12Q7TMF3 145 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dkk4Q8VEJ3 221 aa3.44□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Mast4Q811L6 2618 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Trav4-3A0A0B4J1K1 110 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Socs3O35718 225 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Pglyrp1O88593 182 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Smim26Q3V460 107 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 9430069I07RikQ9CX21 111 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm10553J3QPF1 123 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 BC025920Q3US60 128 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Dand5Q76LW6 185 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Ighv2-6-8A0A0A6YWY9 116 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Igkv1-35A0A0G2JDE5 120 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Prp2P05143 317 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 BlcapP62951 87 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm3250E9Q1M3 230 aa3.42□□□□□ -1.86
Ankrd28-204ENSMUST00000227089 Gm10542F6XDR3 90 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 82.4 ms