RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000089378.4

Sh3bp1-203, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tal2Q62282 108 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Col7a1Q63870 2944 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fhl2O70433 279 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC025920Q3US60 128 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Lyzl4Q9D925 145 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rs1Q9Z1L4 224 aa15.56■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Brd3osA0A1B0GRB6 84 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ss18Q62280 418 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mustn1Q99JI1 82 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spata25Q9DA57 226 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plscr4P58196 326 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tmem170bP86050 132 aa15.55■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bak1O08734 209 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01837 106 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smim1P0C8K7 78 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nav3Q80TN7 2359 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 BC067074F6RXI4 2391 aa15.54■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Krtap27-1E9PX37 202 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Csn3P06796 181 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Runx1Q03347 451 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 AamdcQ8R0P4 122 aa15.53■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm29289A0A087WPY7 166 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm4064A0A087WR82 380 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10352B2RWR6 380 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm21693J3QK27 380 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbmy1a1O35698 380 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 8030423J24RikQ9CX45 142 aa15.52■□□□□ 0.08
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ly86O88188 162 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01753 117 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Bsph2Q0Q236 131 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm8439G3UWA7 96 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tcrg-C3L7N479 172 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P03985 172 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rbx1P62878 108 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ucn2Q99ML8 113 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q9D727 114 aa15.51■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm29666A0A087WQ99 126 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm45213A0A0U1RNZ6 101 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm26727M0QWT1 121 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ccl19O70460 108 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rpl39P62892 51 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cks1brtQ3UNC9 96 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Htr1dQ61224 374 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Synj2bpQ9D6K5 145 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv1-85A0A075B5Y6 117 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Fam240aJ3QNP9 97 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pradc1Q9D9N8 188 aa15.5■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TrrapQ80YV3 2565 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Reg3gO09049 174 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P06329 120 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mllt11P97783 90 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ank2Q8C8R3 3898 aa15.49■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Vamp8O70404 101 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 P01802 115 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnf183Q8QZS5 190 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Muc4Q8JZM8 3443 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Myo9aQ8C170 2542 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cox7cP17665 63 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 4930596D02RikQ3V0H9 216 aa15.48■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FlnaQ8BTM8 2647 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Hivep2Q3UHF7 2430 aa15.47■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10295Q8CCF3 114 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 MturnQ8CGA4 131 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defa34D3Z0J0 93 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Klk1b4P00757 256 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 S100a8P27005 89 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm7489Q3UT34 171 aa15.46■□□□□ 0.07
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 F11rO88792 300 aa15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Spag11Q8K4N2 71 aa15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Timm17aQ9Z0V8 171 aa15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 LrbaQ9ESE1 2856 aa15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pdzd2E9Q1M1 2796 aa15.45■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trav8-1A0A075B641 109 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Trbv30A0A0B4J1P1 111 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm26602M0QWA4 95 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mtatp8P03930 67 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 GalmQ8K157 342 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm10490F6VBM2 120 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defb45Q3V490 66 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Plac1Q9JI83 173 aa15.44■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv2-137A0A0B4J1H6 120 aa15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Igkv4-68A0A0B4J1I7 117 aa15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm26661M0QWV4 156 aa15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Defa13P50711 93 aa15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Smr3aQ61900 147 aa15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Mcrip2Q9CQB2 160 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Tm4sf20Q9CQY8 226 aa15.43■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm1553Q66VB7 94 aa15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm14137Q8CE97 175 aa15.42■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Ighv1-5A0A0A6YWG2 117 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm44965A0A0N4SVR3 59 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Srp14P16254 110 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Nf1Q04690 2841 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Gm2564F6Z9S8 108 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Rnase1P00683 149 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 TtrP07309 147 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Cfc1P97766 202 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Q5BN45 167 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 Pxt1Q8K459 51 aa15.41■□□□□ 0.06
Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 FcorP0DJI6 106 aa15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 76.3 ms