RNA–Protein interactions for RNA: YKR081C

RPF2, Transcript of Essential protein involved in rRNA maturation and ribosomal assembly, yeast

Gene RPF2, Length 1,035 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPF2	YKR081C	ASK10	P48361	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	UBP16	Q02863	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	LCB4	Q12246	624 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPF2	YKR081C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	IMA5	P40884	581 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YNL034W	P53963	612 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	ACS1	Q01574	713 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	VPS64	Q03944	604 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	CRF1	Q04930	467 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YDL242W	Q07746	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	AAD4	Q07747	329 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	VPS8	P39702	1274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	AAT1	Q01802	451 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	PLM2	Q04383	521 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	ARP7	Q12406	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.88	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	FTH1	P38310	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	TGL2	P54857	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	SND1	Q04007	877 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	CRC1	Q12289	327 aa		4.87	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	NIC96	P34077	839 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	ARB1	P40024	610 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	JHD1	P40034	492 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	NOP2	P40991	618 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	IRC7	P43623	340 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YML053C	Q04978	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	TMA7	Q3E764	64 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	MAK32	P23060	363 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	MNT3	P40549	630 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	PEX8	P53248	589 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	AIM6	Q07716	390 aa		4.85	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	RTC1	Q08281	1341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	RAD34	Q06665	692 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	GEP3	Q08622	556 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YOR389W	Q08912	624 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	YPL191C	Q08930	360 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	MPD2	Q99316	277 aa		4.84	□□□□□ -1.63
RPF2	YKR081C	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	PDE1	P22434	369 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SWC3	P31376	625 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SPC97	P38863	823 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	PCI8	P40512	444 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	ESF2	P53743	316 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	COQ3	P27680	312 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SIP1	P32578	815 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YIL024C	P40543	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	CFD1	P40558	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	CIN1	P40987	1014 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	MAD3	P47074	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YAT1	P80235	687 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YOL114C	Q12322	202 aa		4.82	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	TOM20	P35180	183 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	ERC1	P38767	581 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.81	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	ASK1	P35734	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YKL133C	P36066	463 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	STB2	P46679	850 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	TEP1	P53916	434 aa		4.8	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SIR1	P21691	654 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YUR1	P26725	428 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	CAB2	P40506	365 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	TAN1	P53072	289 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	CIR2	Q08822	631 aa		4.79	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YPR089W	O13585	888 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	GRX7	P38068	203 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	MET14	Q02196	202 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	MLC2	Q06580	163 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	ICL2	Q12031	575 aa		4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
RPF2	YKR081C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 62.4 ms