RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	HMI1	Q12039	706 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SKS1	Q12505	502 aa		4.6	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MTF2	P10849	440 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	VPS3	P23643	1011 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SED4	P25365	1065 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SGF29	P25554	259 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	AAR2	P32357	355 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GYP6	P32806	458 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	SDS22	P36047	338 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MRPL36	P36531	177 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	APM3	P38153	483 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RIM11	P38615	370 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YER010C	P40011	234 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YGL176C	P46945	554 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CCM1	P48237	864 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	GCV2	P49095	1034 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RPT4	P53549	437 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	MSH6	Q03834	1242 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RBA50	Q04418	439 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	YLR278C	Q05854	1341 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ECM38	Q05902	660 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	VID22	Q05934	901 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	THI3	Q07471	609 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	ZRT2	Q12436	422 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	RTN2	Q12443	393 aa		4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
KTR2	YKR061W	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MET17	P06106	444 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HTS1	P07263	546 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YCL049C	P25577	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HOG1	P32485	435 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	AFR1	P33304	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TSA1	P34760	196 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YUH1	P35127	236 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	APE3	P37302	537 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PIH1	P38768	344 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	AXL2	P38928	823 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SHU2	P38957	223 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SWD1	P39706	426 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HXT13	P39924	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ATF1	P40353	525 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YJL070C	P40361	888 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ALT1	P52893	592 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	VID30	P53076	958 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	CGR1	P53188	120 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	LSB1	P53281	241 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HXT17	P53631	564 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DSL1	P53847	754 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HXT15	P54854	567 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ECM9	Q02202	377 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	OAZ1	Q02803	292 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GYL1	Q04322	720 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ATG33	Q06485	197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GUP2	Q08929	609 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	HKR1	P41809	1802 aa		4.58	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ARG3	P05150	338 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.57	□□□□□ -1.68	not detected
KTR2	YKR061W	MDL2	P33311	773 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PIK1	P39104	1066 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YEL025C	P39991	1188 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	SHE4	P51534	789 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TEL2	P53038	688 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RPN14	P53196	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	YGR266W	P53326	701 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ARE2	P53629	642 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	ARC35	P53731	342 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	PEX13	P80667	386 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	UBX2	Q04228	584 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	RSF1	Q05043	376 aa		4.57	□□□□□ -1.68
KTR2	YKR061W	TRE1	Q08919	783 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 13 ms