RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597315.5

BRD4-208, Transcript of bromodomain containing 4, human

TSL 5

Gene BRD4, Length 892 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BRD4-208	ENST00000597315	RWDD1	Q9H446	243 aa	Predicted RBP	32.57	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	LAMB1	P07942	1786 aa		32.57	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	DGKZ	Q13574	1117 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	32.56	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		32.56	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	FKTN	O75072	461 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	SLURP2	P0DP57	97 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	ADD2	P35612	726 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	TAF1C	Q15572	869 aa	Predicted RBP	32.55	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		32.55	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	32.55	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	PTPRA	P18433	802 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	ZFYVE28	Q9HCC9	887 aa		32.54	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	CXCL11	O14625	94 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	TTC6	Q86TZ1	520 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		32.53	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	CRHR2	Q13324	411 aa		32.52	■■■□□ 2.8
BRD4-208	ENST00000597315	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	CAPN15	O75808	1086 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	UBE3C	Q15386	1083 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		32.51	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	32.51	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	MX1	P20591	662 aa		32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	CAP2	P40123	477 aa		32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	CTU1	Q7Z7A3	348 aa	Known RBP	32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	MCOLN1	Q9GZU1	580 aa		32.5	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	DOCK1	Q14185	1865 aa		32.49	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	BTBD19	C9JJ37	291 aa		32.49	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	ARMT1	Q9H993	441 aa		32.49	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	MBD4	O95243	580 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	32.48	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	LCORL	Q8N3X6	602 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	DDRGK1	Q96HY6	314 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		32.48	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	MYH1	P12882	1939 aa		32.47	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	TRIM75P	A6NK02	468 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	ABHD8	Q96I13	439 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		32.46	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	USP17L5	A8MUK1	530 aa		32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	ASNS	P08243	561 aa		32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		32.45	■■■□□ 2.79
BRD4-208	ENST00000597315	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	ERO1A	Q96HE7	468 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	EHD4	Q9H223	541 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	GINM1	Q9NU53	330 aa		32.44	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	32.44	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315		A0A0G2JLL6	359 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PDHX	O00330	501 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	SP3	Q02447	781 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PRRT2	Q7Z6L0	340 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	MYH7	P12883	1935 aa		32.43	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	32.42	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	DNAJC18	Q9H819	358 aa		32.42	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	32.42	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	32.41	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	GDF11	O95390	407 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	SPP2	Q13103	211 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	FSD1	Q9BTV5	496 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		32.41	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	SIPA1L1	O43166	1804 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	TLR2	O60603	784 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	ARHGEF6	Q15052	776 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	NAV1	Q8NEY1	1877 aa		32.4	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	CHGB	P05060	677 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	PLCD1	P51178	756 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	SMC5	Q8IY18	1101 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	APPBP2	Q92624	585 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	LNPK	Q9C0E8	428 aa		32.39	■■■□□ 2.78
BRD4-208	ENST00000597315	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		32.38	■■■□□ 2.77
BRD4-208	ENST00000597315	PRKAB2	O43741	272 aa		32.38	■■■□□ 2.77

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