RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543002.5

RABGGTA-203, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTA, Length 1,329 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-203ENST00000543002 EHD4Q9H223 541 aa20.49■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 SIPA1L1O43166 1804 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 FAM196BA6NMK8 535 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 PHF20L1A8MW92 1017 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L12C9JPN9 530 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 USP17L21D6R901 530 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 FOXP2O15409 715 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 PLCD1P51178 756 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 IFNL3Q8IZI9 196 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 NACAP1Q9BZK3 213 aa20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 SERPINB13Q9UIV8 391 aa20.48■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 C12orf60Q5U649 245 aa20.47■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 VPS53Q5VIR6 699 aa20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 DNAJC18Q9H819 358 aa20.47■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa20.46■□□□□ 0.87
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RABGGTA-203ENST00000543002 SLC10A4Q96EP9 437 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CLMNQ96JQ2 1002 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 TAOK2Q9UL54 1235 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 CSADQ9Y600 493 aa20.46■□□□□ 0.87
RABGGTA-203ENST00000543002 OTOFQ9HC10 1997 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa20.45■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 SLC10A3P09131 477 aa20.44■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 CDC45O75419 566 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 CAP2P40123 477 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 DYNLL2Q96FJ2 89 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 SWAP70Q9UH65 585 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.42■□□□□ 0.86
RABGGTA-203ENST00000543002 ZMYM6O95789 1325 aa20.42■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 ROBO3Q96MS0 1386 aa20.41■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 SLC44A5Q8NCS7 719 aa20.4■□□□□ 0.86
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RABGGTA-203ENST00000543002 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 GINM1Q9NU53 330 aa20.39■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 GJA5P36382 358 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 PPATQ06203 517 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 ANAPC4Q9UJX5 808 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 LAMB1P07942 1786 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 DOCK1Q14185 1865 aa20.38■□□□□ 0.85
RABGGTA-203ENST00000543002 AOC2O75106 756 aa20.37■□□□□ 0.85
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