RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 TEX11Q8IYF3 940 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SCAIQ8N9R8 606 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MPP4Q96JB8 637 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 AP1S3Q96PC3 154 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 NUDCD1Q96RS6 583 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 THTPAQ9BU02 230 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM192AQ9GZU8 254 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 TMOD2Q9NZR1 351 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GGA2Q9UJY4 613 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA8KD6RF30 607 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 M0R3G1 203 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MYCP01106 439 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 APOA1P02647 267 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA8HP0CJ92 632 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PDCP20941 246 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GARSP41250 739 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 TNNC1P63316 161 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC24Q8N4L8 307 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 FLCNQ8NFG4 579 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 WASF1Q92558 559 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPF18Q99633 342 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 OLFML3Q9NRN5 406 aa3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 POTEFA5A3E0 1075 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 BFSP1Q12934 665 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CNGA4Q8IV77 575 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MCUR1Q96AQ8 359 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CNBD2Q96M20 576 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 FOXP3Q9BZS1 431 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC7Q96M83 1385 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP3K13O43283 966 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCD1P33897 745 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PSME3P61289 254 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MYRFLQ96LU7 910 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SPZ1Q9BXG8 430 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ANO2Q9NQ90 1003 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 BLOC1S6Q9UL45 172 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 L1RE1Q9UN81 338 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 MEIS1O00470 390 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SOX12O15370 315 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 OCM2P0CE71 109 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 DDX5P17844 614 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SYT1P21579 422 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 FAPQ12884 760 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CEP78Q5JTW2 689 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP6V1C2Q8NEY4 427 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRN2Q92932 1015 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PHACTR3Q96KR7 559 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 KIF17Q9P2E2 1029 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PPME1Q9Y570 386 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 NINLQ9Y2I6 1382 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GOLGA8JA6NMD2 632 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ASPHQ12797 758 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 EFR3AQ14156 821 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ANKRD1Q15327 319 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF699Q32M78 642 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF568Q3ZCX4 644 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 GRAMD4Q6IC98 578 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 CAMK1DQ8IU85 385 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 FBXO41Q8TF61 875 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 RBSNQ9H1K0 784 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 VAV3Q9UKW4 847 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 KRT14P02533 472 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 UBA7P41226 1012 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 KLHL12Q53G59 568 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 VPS37DQ86XT2 251 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 HSPH1Q92598 858 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 PHF21AQ96BD5 680 aa3.48□□□□□ -1.85
JMJD1C-210ENST00000542921 TRIM15Q9C019 465 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.9 ms