RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ZBTB3Q9H5J0 574 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 CXorf56Q9H5V9 222 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ANKRD65E5RJM6 399 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC175P0C221 793 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 XBP1P17861 261 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 KCNA4P22459 653 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 DIXDC1Q155Q3 683 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 VCXQ9H320 206 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC87Q9NVE4 849 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 KDM4AO75164 1064 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 A1BGP04217 495 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ARMC9Q7Z3E5 817 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 EFCAB13Q8IY85 973 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 IFT74Q96LB3 600 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 NEUROD6Q96NK8 337 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 DBNDD2Q9BQY9 259 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 TCHPQ9BT92 498 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 MTA3Q9BTC8 594 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 FAM184BQ9ULE4 1060 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 PSMD2Q13200 908 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 HDXQ7Z353 690 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC10Q8IXB1 793 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ARAP2Q8WZ64 1704 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 CTSWP56202 376 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 CLEC4GQ6UXB4 293 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 NLRP10Q86W26 655 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 RANBP1P43487 201 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ME1P48163 572 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ATP2B2Q01814 1243 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 ANKS4BQ8N8V4 417 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 SLIT2O94813 1529 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 A0A0D9SFI3 127 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 PTH1RQ03431 593 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 STIM1Q13586 685 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 BRD3Q15059 726 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 APPBP2Q92624 585 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-214ENST00000540109 SLC5A1P13866 664 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 GYS2P54840 703 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 EVCP57679 992 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 STK3Q13188 491 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 RASEFQ8IZ41 740 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 MED4Q9NPJ6 270 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 MYH3P11055 1940 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 RHOXF2BP0C7M4 288 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 SPAG1Q07617 926 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 UBE3CQ15386 1083 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF34Q8IZ26 560 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 AFAP1L1Q8TED9 768 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 RHOXF2Q9BQY4 288 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 GNAT2P19087 354 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 PAFAH1B1P43034 410 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF165P49910 485 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC152Q4G0S7 254 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 GOLGA1Q92805 767 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 GJB2P29033 226 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 METTL24Q5JXM2 366 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 FAM227BQ96M60 508 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 NLRP5P59047 1200 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 MAATS1Q7Z4T9 603 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 CNNM1Q9NRU3 951 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 ODF2LQ9ULJ1 636 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 TOP1P11387 765 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 SYT1P21579 422 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 PCK1P35558 622 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 STX1AQ16623 288 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 CCHCR1Q8TD31 782 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 LPIN2Q92539 896 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 IQCDQ96DY2 449 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-214ENST00000540109 MPHOSPH8Q99549 860 aa6.82□□□□□ -1.32
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