RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 SPP2Q13103 211 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF280CQ8ND82 737 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 C1orf115Q9H7X2 142 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 AS3MTQ9HBK9 375 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 CAP2P40123 477 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PRKCZQ05513 592 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 MTFR1Q15390 333 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 SLAIN1Q8ND83 568 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-220ENST00000511663 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L5A8MUK1 530 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 MIER1Q8N108 512 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 RNF208Q9H0X6 261 aa23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 PPP4CP60510 307 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 COA7Q96BR5 231 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 DOCK1Q14185 1865 aa23.56■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CCL5P13501 91 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ZAP70P43403 619 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 GABRQQ9UN88 632 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ADCY3O60266 1144 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 GJB1P08034 283 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 FLT3LGP49771 235 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 TREML2Q5T2D2 321 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 HLA-DOAP06340 250 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ASNSP08243 561 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 HMGCS2P54868 508 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 ERC1Q8IUD2 1116 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 TMOD4Q9NZQ9 345 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 TAOK2Q9UL54 1235 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 MS4A1P11836 297 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CYP7A1P22680 504 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 GJA8P48165 433 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 CERS3Q8IU89 383 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 PXYLP1Q8TE99 480 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 DPF3Q92784 378 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-220ENST00000511663 IDH1O75874 414 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 RLBP1P12271 317 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 IRF5Q13568 498 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM110CQ1W6H9 321 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 GINM1Q9NU53 330 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 PALD1Q9ULE6 856 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 SH3D19Q5HYK7 790 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 HTATIP2Q9BUP3 242 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 WDR18Q9BV38 432 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 FLT1P17948 1338 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 C19orf81C9J6K1 198 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPN2P17655 700 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 USP5P45974 858 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 MAP3K12Q12852 859 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 PHIPQ8WWQ0 1821 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 ELNP15502 786 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 BACE1P56817 501 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 CEP85Q6P2H3 762 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 UNC93B1Q9H1C4 597 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 MGAMO43451 1857 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 USP17L10C9JJH3 530 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 SGPL1O95470 568 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 TFRCP02786 760 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 MTMR2Q13614 643 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 AACSQ86V21 672 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 SHISA4Q96DD7 197 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 HTTP42858 3142 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 PTPRFP10586 1907 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 INHAP05111 366 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-220ENST00000511663 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP23.46■■□□□ 1.35
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