RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455580.5

PPP1CB-208, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit beta, human

TSL 3

Gene PPP1CB, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP1CB-208	ENST00000455580	HERC5	Q9UII4	1024 aa	Known RBP	29.26	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAP3K12	Q12852	859 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	C17orf99	Q6UX52	265 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	29.25	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAGEB6	Q8N7X4	407 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	PPIL4	Q8WUA2	492 aa	Known RBP eCLIP	29.25	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	FLT1	P17948	1338 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	CAP2	P40123	477 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	CERS3	Q8IU89	383 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	CPA4	Q9UI42	421 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	KIF22	Q14807	665 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	PALD1	Q9ULE6	856 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRIM75P	A6NK02	468 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	DOCK1	Q14185	1865 aa		29.2	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	BCL11A	Q9H165	835 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		29.19	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	CYP2C8	P10632	490 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNAJC18	Q9H819	358 aa		29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	29.18	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	GNRH1	P01148	92 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	SPP2	Q13103	211 aa		29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	DNAJC2	Q99543	621 aa	Known RBP	29.17	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP17L5	A8MUK1	530 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	GOLIM4	O00461	696 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	USP5	P45974	858 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	ARMC5	Q96C12	935 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	HTT	P42858	3142 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		29.16	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	HLA-DOA	P06340	250 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	BCR	P11274	1271 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	PDE6A	P16499	860 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATP5J	P18859	108 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTCH2	Q9Y6C5	1203 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		29.15	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	CTGF	P29279	349 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	SIPA1L1	O43166	1804 aa		29.14	■■■□□ 2.26
PPP1CB-208	ENST00000455580	PSMC4	P43686	418 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	JAG1	P78504	1218 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	DCTPP1	Q9H773	170 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	GINM1	Q9NU53	330 aa		29.13	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	ASNS	P08243	561 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	PRMT2	P55345	433 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	WDR18	Q9BV38	432 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	PAG1	Q9NWQ8	432 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	PTPRF	P10586	1907 aa		29.12	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	TREML2	Q5T2D2	321 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	TRIM47	Q96LD4	638 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	HAUS7	Q99871	368 aa		29.11	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	29.1	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	NBPF11	Q86T75	865 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	TTC6	Q86TZ1	520 aa		29.1	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	HOXD10	P28358	340 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	HMGCS2	P54868	508 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZNF333	Q96JL9	665 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	EHD4	Q9H223	541 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	SRRD	Q9UH36	339 aa		29.09	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	GDF11	O95390	407 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	ATAD5	Q96QE3	1844 aa		29.08	■■■□□ 2.25
PPP1CB-208	ENST00000455580	OSBP	P22059	807 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	BACE1	P56817	501 aa		29.07	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	29.07	■■■□□ 2.24
PPP1CB-208	ENST00000455580	PNMA3	Q9UL41	463 aa		29.07	■■■□□ 2.24

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