RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429374.5

HDAC10-204, Transcript of histone deacetylase 10, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC10, Length 1,634 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC10-204ENST00000429374 CCDC178Q5BJE1 867 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 SENP2Q9HC62 589 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 CFAP45Q9UL16 551 aa22.16■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 DTNBO60941 627 aa22.15■■□□□ 1.14
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HDAC10-204ENST00000429374 CALM2P0DP24 149 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 CALM3P0DP25 149 aa22.15■■□□□ 1.14
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HDAC10-204ENST00000429374 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 FERMT3Q86UX7 667 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 SUPT20HQ8NEM7 779 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF287Q9HBT7 754 aa22.15■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 TNKSO95271 1327 aa22.14■■□□□ 1.14
HDAC10-204ENST00000429374 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.14■■□□□ 1.14
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HDAC10-204ENST00000429374 C8orf76Q96K31 380 aa22.14■■□□□ 1.14
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HDAC10-204ENST00000429374 G3V3G9 751 aa22.13■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 USP17L8P0C7I0 530 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.12■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 BRAPQ7Z569 592 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 TEX11Q8IYF3 940 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 FANCBQ8NB91 859 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 ANKS1AQ92625 1134 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa22.12■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa22.12■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 MYH1P12882 1939 aa22.1■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 SMIM22K7EJ46 135 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 DGKHQ86XP1 1220 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 TRIM22Q8IYM9 498 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 CERS5Q8N5B7 392 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 SPATA32Q96LK8 384 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 MAP3K14Q99558 947 aa22.09■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 CYP2D6P10635 497 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 DOK7Q18PE1 504 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.09■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 VPS33BQ9H267 617 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
HDAC10-204ENST00000429374 KIAA2012Q0VF49 1180 aa22.08■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.08■■□□□ 1.13
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HDAC10-204ENST00000429374 FLT1P17948 1338 aa22.08■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 ECM29Q5VYK3 1845 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 TSPY2A6NKD2 308 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 PRDM1O75626 825 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 DEXIO95424 95 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 RXRAP19793 462 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 TROAPQ12815 778 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 RTKN2Q8IZC4 609 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 TTLL6Q8N841 843 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 MYL10Q9BUA6 226 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 MKNK2Q9HBH9 465 aa22.07■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 FAM173BQ6P4H8 233 aa22.06■■□□□ 1.12
HDAC10-204ENST00000429374 NBPF11Q86T75 865 aa22.06■■□□□ 1.12
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