RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423339.2

CCDC82-202, Transcript of coiled-coil domain containing 82, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC82, Length 1,878 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82-202ENST00000423339 GLI1P08151 1106 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 FAM87AP0C7U9 286 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 C1QTNF9P0C862 333 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 ITPKAP23677 461 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 MAOBP27338 520 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF423Q2M1K9 1284 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 NRSN2Q9GZP1 204 aa5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP5.19□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 CEACAM5P06731 702 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM253P0C7T8 217 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 FGD1P98174 961 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PCDH1Q08174 1060 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 DTHD1Q6ZMT9 781 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 FAM181AQ8N9Y4 354 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 RELTQ969Z4 430 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF576Q9H609 170 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PPP4R2Q9NY27 417 aa5.18□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 CORO1BQ9BR76 489 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 SPG7Q9UQ90 795 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 VAMP1P23763 118 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 ASB11Q8WXH4 323 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PARP2Q9UGN5 583 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 CTNND2Q9UQB3 1225 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 AKAP2Q9Y2D5 859 aa5.17□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 NPIPB6E9PJ23 425 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 CD96P40200 585 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 FAAP100Q0VG06 881 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PRR23BQ6ZRT6 265 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 FAM161BQ96MY7 647 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 C12orf49Q9H741 205 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 PIDD1Q9HB75 910 aa5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.16□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 GNA15P30679 374 aa5.15□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 C3orf58Q8NDZ4 430 aa5.15□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 KIRREL1Q96J84 757 aa5.15□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 LGR6Q9HBX8 967 aa5.15□□□□□ -1.58
CCDC82-202ENST00000423339 TCAF2A6NFQ2 919 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 GIPC1O14908 333 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 B3GALT4O96024 378 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 GSTT1P30711 240 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 IKZF1Q13422 519 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 BCL11AQ9H165 835 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ATXN3LQ9H3M9 355 aa5.15□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 FBXO24O75426 580 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 USP17L7P0C7H9 530 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 HOXA5P20719 270 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 OXCT1P55809 520 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ZP2Q05996 745 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 KCNA10Q16322 511 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 AK5Q9Y6K8 562 aa5.14□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 AOC2O75106 756 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PSMD2Q13200 908 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 CDK5R2Q13319 367 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 CYFIP1Q7L576 1253 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 BORCS6Q96GS4 357 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 FRMD6Q96NE9 622 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TNKS2Q9H2K2 1166 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ECEL1O95672 775 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ITGAEP38570 1179 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 DAB2P98082 770 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PDE3AQ14432 1141 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TPTE2Q6XPS3 522 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 CD320Q9NPF0 282 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 IGSF5Q9NSI5 407 aa5.13□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 KRT1P04264 644 aa5.12□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 CTSBP07858 339 aa5.12□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 CCDC120Q96HB5 630 aa5.12□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TMEM39AQ9NV64 488 aa5.12□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 MED14OSP0DP75 135 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TMC4Q7Z404 712 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PLAGL2Q9UPG8 496 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 NUAK1O60285 661 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 SLFN14P0C7P3 912 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 AP3B2Q13367 1082 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ATG14Q6ZNE5 492 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 WDR18Q9BV38 432 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 PRDM7Q9NQW5 492 aa5.11□□□□□ -1.59
CCDC82-202ENST00000423339 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.8 ms