RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254667.7

PTPRE-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type E, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRE, Length 5,331 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRE-201ENST00000254667 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 GJC1P36383 396 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 PAK1Q13153 545 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 DLGAP5Q15398 846 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF354CQ86Y25 554 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 IGSF22Q8N9C0 903 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 PKD2L1Q9P0L9 805 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 NLRP1Q9C000 1473 aa21.24■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 BIRC3Q13489 604 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 SNX29Q8TEQ0 813 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CHMP2AO43633 222 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC122Q5T0U0 273 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 APBA3O96018 575 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 VAV2P52735 878 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TEKT1Q969V4 418 aa21.23■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 STRN3Q13033 797 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 DNM3Q9UQ16 869 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 BAG6P46379 1132 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TUBB2AQ13885 445 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TTC14Q96N46 770 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TUBB2BQ9BVA1 445 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 KCNG1Q9UIX4 513 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CCDC169A6NNP5 214 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 NAP1L3Q99457 506 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF202O95125 648 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 NLRP12P59046 1061 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 DPH6Q7L8W6 267 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 JAKMIP2Q96AA8 810 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 HAUS7Q99871 368 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.22■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 KCNQ3O43525 872 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CALCRLQ16602 461 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 SEL1L2Q5TEA6 688 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 NCAPH2Q6IBW4 605 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 STX10O60499 249 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TNFAIP1Q13829 316 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 GTF3C6Q969F1 213 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CARD10Q9BWT7 1032 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TMEM94Q12767 1356 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CYP26C1Q6V0L0 522 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 PHKBQ93100 1093 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 MYL10Q9BUA6 226 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 MCM6Q14566 821 aa21.2■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CDAN1Q8IWY9 1227 aa21.2■□□□□ 0.99
PTPRE-201ENST00000254667 CA8P35219 290 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 TNFAIP3P21580 790 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 ZNF654Q8IZM8 581 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 USP40Q9NVE5 1235 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 METP08581 1390 aa21.2■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 SLC8A3P57103 927 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 SYT10Q6XYQ8 523 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 KIAA1524Q8TCG1 905 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 CHURC1Q8WUH1 139 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 PPIP5K2O43314 1243 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 CAPZA3Q96KX2 299 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 NT5C3AQ9H0P0 336 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 NOP56O00567 594 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 CALCOCO2Q13137 446 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 GPR108Q9NPR9 543 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 COPRSQ9NQ92 184 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 IMPACTQ9P2X3 320 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 IGSF1Q8N6C5 1336 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 SYNMO15061 1565 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 PCP11498 1178 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 PLEKHF1Q96S99 279 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 CSRNP2Q9H175 543 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 VPS16Q9H269 839 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 FANCCQ00597 558 aa21.19■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 POSTNQ15063 836 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 IFNL3Q8IZI9 196 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP21.18■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 PDE6AP16499 860 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 GTF2IP78347 998 aa21.18■□□□□ 0.98
PTPRE-201ENST00000254667 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 89 ms