RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617474.1

PTPRT-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, human

TSL 5

Gene PTPRT, Length 4,521 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRT-210	ENST00000617474	SPRR2B	P35325	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRT-210	ENST00000617474	SPRR2A	P35326	72 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PTPRT-210	ENST00000617474	FCGBP	Q9Y6R7	5405 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE2A	Q5TA79	106 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PTPRT-210	ENST00000617474	USH2A	O75445	5202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPRT-210	ENST00000617474	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTPRT-210	ENST00000617474	MT1M	Q8N339	61 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
PTPRT-210	ENST00000617474	SPRR2D	P22532	72 aa		4.76	□□□□□ -1.65
PTPRT-210	ENST00000617474	KMT2D	O14686	5537 aa		4.72	□□□□□ -1.65
PTPRT-210	ENST00000617474	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.7	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP19-6	Q3LI70	58 aa		4.69	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		4.68	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	PRM1	P04553	51 aa		4.65	□□□□□ -1.66
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.58	□□□□□ -1.68
PTPRT-210	ENST00000617474	MT3	P25713	68 aa		4.45	□□□□□ -1.7
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
PTPRT-210	ENST00000617474	MT1A	P04731	61 aa		4.4	□□□□□ -1.71
PTPRT-210	ENST00000617474	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		4.39	□□□□□ -1.71
PTPRT-210	ENST00000617474	MT4	P47944	62 aa		4.37	□□□□□ -1.71
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.34	□□□□□ -1.71
PTPRT-210	ENST00000617474	SSPO	A2VEC9	5147 aa		4.34	□□□□□ -1.72
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.25	□□□□□ -1.73
PTPRT-210	ENST00000617474	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	4.25	□□□□□ -1.73
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.24	□□□□□ -1.73
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.23	□□□□□ -1.73
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.18	□□□□□ -1.74
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.14	□□□□□ -1.75
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PTPRT-210	ENST00000617474	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.03	□□□□□ -1.76
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4	□□□□□ -1.77
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		3.94	□□□□□ -1.78
PTPRT-210	ENST00000617474	MDN1	Q9NU22	5596 aa		3.86	□□□□□ -1.79
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		3.75	□□□□□ -1.81
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-9	P26371	169 aa		3.71	□□□□□ -1.81
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		3.69	□□□□□ -1.82
PTPRT-210	ENST00000617474	NEB	P20929	6669 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.6	□□□□□ -1.83
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.54	□□□□□ -1.84
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.52	□□□□□ -1.85
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPRT-210	ENST00000617474	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.37	□□□□□ -1.87
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.34	□□□□□ -1.87
PTPRT-210	ENST00000617474	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.29	□□□□□ -1.88
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.2	□□□□□ -1.9
PTPRT-210	ENST00000617474	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.15	□□□□□ -1.9
PTPRT-210	ENST00000617474	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.12	□□□□□ -1.91
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.04	□□□□□ -1.92
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.01	□□□□□ -1.93
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		2.99	□□□□□ -1.93
PTPRT-210	ENST00000617474	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		2.76	□□□□□ -1.97
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		2.74	□□□□□ -1.97
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		2.73	□□□□□ -1.97
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.69	□□□□□ -1.98
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.58	□□□□□ -2
PTPRT-210	ENST00000617474	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.43	□□□□□ -2.02
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.42	□□□□□ -2.02
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.33	□□□□□ -2.04
PTPRT-210	ENST00000617474	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.32	□□□□□ -2.04
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.22	□□□□□ -2.05
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.13	□□□□□ -2.07
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.08	□□□□□ -2.08
PTPRT-210	ENST00000617474	PHGR1	C9JFL3	82 aa		1.93	□□□□□ -2.1
PTPRT-210	ENST00000617474	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		1.92	□□□□□ -2.1
PTPRT-210	ENST00000617474	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.33	□□□□□ -2.2

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