RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617199.1

MFGE8-217, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

Gene MFGE8, Length 2,464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.65□□□□□ -1.67
MFGE8-217ENST00000617199 INE1O15225 51 aa4.63□□□□□ -1.67
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.61□□□□□ -1.67
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.61□□□□□ -1.67
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.58□□□□□ -1.68
MFGE8-217ENST00000617199 MT1EP04732 61 aa4.54□□□□□ -1.68
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.51□□□□□ -1.69
MFGE8-217ENST00000617199 MT1LQ93083 61 aa4.51□□□□□ -1.69
MFGE8-217ENST00000617199 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.5□□□□□ -1.69
MFGE8-217ENST00000617199 LCE1DQ5T752 114 aa4.49□□□□□ -1.69
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.46□□□□□ -1.7
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.45□□□□□ -1.7
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.44□□□□□ -1.7
MFGE8-217ENST00000617199 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.38□□□□□ -1.71
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.33□□□□□ -1.72
MFGE8-217ENST00000617199 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.3□□□□□ -1.72
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.28□□□□□ -1.72
MFGE8-217ENST00000617199 MT1GP13640 62 aa4.26□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 MT1MQ8N339 61 aa4.26□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa4.25□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa4.25□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.25□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.25□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.24□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.23□□□□□ -1.73
MFGE8-217ENST00000617199 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.21□□□□□ -1.74
MFGE8-217ENST00000617199 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.16□□□□□ -1.74
MFGE8-217ENST00000617199 NEBP20929 6669 aa4.15□□□□□ -1.75
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.14□□□□□ -1.75
MFGE8-217ENST00000617199 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-9P26371 169 aa4□□□□□ -1.77
MFGE8-217ENST00000617199 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
MFGE8-217ENST00000617199 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.96□□□□□ -1.78
MFGE8-217ENST00000617199 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
MFGE8-217ENST00000617199 MDN1Q9NU22 5596 aa3.94□□□□□ -1.78
MFGE8-217ENST00000617199 SPRR2EP22531 72 aa3.88□□□□□ -1.79
MFGE8-217ENST00000617199 SPRR2BP35325 72 aa3.88□□□□□ -1.79
MFGE8-217ENST00000617199 SPRR2AP35326 72 aa3.88□□□□□ -1.79
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.82□□□□□ -1.8
MFGE8-217ENST00000617199 MT1AP04731 61 aa3.81□□□□□ -1.8
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.81□□□□□ -1.8
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.78□□□□□ -1.8
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa3.76□□□□□ -1.81
MFGE8-217ENST00000617199 SPRR2DP22532 72 aa3.73□□□□□ -1.81
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP12-4P60329 112 aa3.7□□□□□ -1.82
MFGE8-217ENST00000617199 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
MFGE8-217ENST00000617199 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
MFGE8-217ENST00000617199 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
MFGE8-217ENST00000617199 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.56□□□□□ -1.84
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.55□□□□□ -1.84
MFGE8-217ENST00000617199 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.5□□□□□ -1.85
MFGE8-217ENST00000617199 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.47□□□□□ -1.85
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.45□□□□□ -1.86
MFGE8-217ENST00000617199 MT3P25713 68 aa3.43□□□□□ -1.86
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.42□□□□□ -1.86
MFGE8-217ENST00000617199 LCE4AQ5TA78 99 aa3.35□□□□□ -1.87
MFGE8-217ENST00000617199 LCE1FQ5T754 118 aa3.35□□□□□ -1.87
MFGE8-217ENST00000617199 MT4P47944 62 aa3.26□□□□□ -1.89
MFGE8-217ENST00000617199 PRM1P04553 51 aa3.26□□□□□ -1.89
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.21□□□□□ -1.9
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.21□□□□□ -1.9
MFGE8-217ENST00000617199 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.21□□□□□ -1.9
MFGE8-217ENST00000617199 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.21□□□□□ -1.9
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.17□□□□□ -1.9
MFGE8-217ENST00000617199 LCE1EQ5T753 118 aa3.1□□□□□ -1.91
MFGE8-217ENST00000617199 MUC5ACP98088 5654 aa3.02□□□□□ -1.93
MFGE8-217ENST00000617199 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.77□□□□□ -1.97
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.7□□□□□ -1.98
MFGE8-217ENST00000617199 LCE1CQ5T751 118 aa2.68□□□□□ -1.98
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.68□□□□□ -1.98
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP5-8O75690 187 aa2.61□□□□□ -1.99
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.52□□□□□ -2.01
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.47□□□□□ -2.01
MFGE8-217ENST00000617199 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.29□□□□□ -2.04
MFGE8-217ENST00000617199 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.03□□□□□ -2.08
MFGE8-217ENST00000617199 PHGR1C9JFL3 82 aa2.02□□□□□ -2.09
MFGE8-217ENST00000617199 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.33□□□□□ -2.2
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 58 ms