RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.48□□□□□ -1.85
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.44□□□□□ -1.86
HCG18-242ENST00000602319 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.4□□□□□ -1.87
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.37□□□□□ -1.87
HCG18-242ENST00000602319 MT1LQ93083 61 aa3.35□□□□□ -1.87
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.34□□□□□ -1.87
HCG18-242ENST00000602319 LCE3BQ5TA77 95 aa3.34□□□□□ -1.88
HCG18-242ENST00000602319 KMT2DO14686 5537 aa3.33□□□□□ -1.88
HCG18-242ENST00000602319 MT1EP04732 61 aa3.32□□□□□ -1.88
HCG18-242ENST00000602319 USH2AO75445 5202 aa3.2□□□□□ -1.9
HCG18-242ENST00000602319 SSPOA2VEC9 5147 aa3.16□□□□□ -1.9
HCG18-242ENST00000602319 LCE1DQ5T752 114 aa3.14□□□□□ -1.91
HCG18-242ENST00000602319 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.11□□□□□ -1.91
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP12-4P60329 112 aa3.1□□□□□ -1.91
HCG18-242ENST00000602319 MT1MQ8N339 61 aa3.07□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.07□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 MT1GP13640 62 aa3.06□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.05□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.05□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.04□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 LCE1FQ5T754 118 aa3.03□□□□□ -1.92
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.02□□□□□ -1.93
HCG18-242ENST00000602319 MT1AP04731 61 aa3.01□□□□□ -1.93
HCG18-242ENST00000602319 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.98□□□□□ -1.93
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.97□□□□□ -1.93
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.96□□□□□ -1.94
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.89□□□□□ -1.95
HCG18-242ENST00000602319 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.88□□□□□ -1.95
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.85□□□□□ -1.95
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.82□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.82□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.81□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.81□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.81□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-9P26371 169 aa2.79□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 PRM1P04553 51 aa2.79□□□□□ -1.96
HCG18-242ENST00000602319 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.71□□□□□ -1.98
HCG18-242ENST00000602319 MT3P25713 68 aa2.68□□□□□ -1.98
HCG18-242ENST00000602319 NEBP20929 6669 aa2.67□□□□□ -1.98
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.66□□□□□ -1.98
HCG18-242ENST00000602319 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.57□□□□□ -2
HCG18-242ENST00000602319 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
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HCG18-242ENST00000602319 SPRR2AP35326 72 aa2.5□□□□□ -2.01
HCG18-242ENST00000602319 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
HCG18-242ENST00000602319 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.47□□□□□ -2.01
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HCG18-242ENST00000602319 SPRR2EP22531 72 aa2.43□□□□□ -2.02
HCG18-242ENST00000602319 LCE1EQ5T753 118 aa2.42□□□□□ -2.02
HCG18-242ENST00000602319 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.41□□□□□ -2.02
HCG18-242ENST00000602319 SPRR2BP35325 72 aa2.38□□□□□ -2.03
HCG18-242ENST00000602319 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.33□□□□□ -2.04
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.31□□□□□ -2.04
HCG18-242ENST00000602319 SPRR2DP22532 72 aa2.27□□□□□ -2.05
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.25□□□□□ -2.05
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.23□□□□□ -2.05
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.2□□□□□ -2.06
HCG18-242ENST00000602319 MUC5ACP98088 5654 aa2.14□□□□□ -2.07
HCG18-242ENST00000602319 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.1□□□□□ -2.07
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.09□□□□□ -2.07
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
HCG18-242ENST00000602319 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.04□□□□□ -2.08
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.03□□□□□ -2.08
HCG18-242ENST00000602319 MT4P47944 62 aa1.95□□□□□ -2.1
HCG18-242ENST00000602319 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.94□□□□□ -2.1
HCG18-242ENST00000602319 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.92□□□□□ -2.1
HCG18-242ENST00000602319 LCE1CQ5T751 118 aa1.92□□□□□ -2.1
HCG18-242ENST00000602319 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.92□□□□□ -2.1
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.89□□□□□ -2.11
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP5-8O75690 187 aa1.86□□□□□ -2.11
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.86□□□□□ -2.11
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.61□□□□□ -2.15
HCG18-242ENST00000602319 PHGR1C9JFL3 82 aa1.4□□□□□ -2.19
HCG18-242ENST00000602319 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
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