RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000598038.5

GTPBP3-216, Transcript of GTP binding protein 3, mitochondrial, human

TSL 5

Gene GTPBP3, Length 2,917 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP3-216	ENST00000598038	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.64	□□□□□ -1.51
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		5.61	□□□□□ -1.51
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	5.55	□□□□□ -1.52
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		5.54	□□□□□ -1.52
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT1E	P04732	61 aa		5.51	□□□□□ -1.53
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.47	□□□□□ -1.53
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		5.41	□□□□□ -1.54
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT1L	Q93083	61 aa		5.39	□□□□□ -1.55
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.37	□□□□□ -1.55
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPRR2E	P22531	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPRR2B	P35325	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPRR2A	P35326	72 aa		5.29	□□□□□ -1.56
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		5.28	□□□□□ -1.56
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-9	P26371	169 aa		5.27	□□□□□ -1.57
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.25	□□□□□ -1.57
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT1M	Q8N339	61 aa		5.21	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		5.2	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.17	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.16	□□□□□ -1.58
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT1G	P13640	62 aa		5.13	□□□□□ -1.59
GTPBP3-216	ENST00000598038	NEB	P20929	6669 aa		5.13	□□□□□ -1.59
GTPBP3-216	ENST00000598038	SPRR2D	P22532	72 aa		5.07	□□□□□ -1.6
GTPBP3-216	ENST00000598038	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP12-4	P60329	112 aa		5	□□□□□ -1.61
GTPBP3-216	ENST00000598038	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5	□□□□□ -1.61
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.85	□□□□□ -1.63
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.82	□□□□□ -1.64
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		4.71	□□□□□ -1.66
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT4	P47944	62 aa		4.59	□□□□□ -1.68
GTPBP3-216	ENST00000598038	PRM1	P04553	51 aa		4.55	□□□□□ -1.68
GTPBP3-216	ENST00000598038	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.54	□□□□□ -1.68
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT1A	P04731	61 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		4.49	□□□□□ -1.69
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE1D	Q5T752	114 aa		4.38	□□□□□ -1.71
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.36	□□□□□ -1.71
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		4.31	□□□□□ -1.72
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.28	□□□□□ -1.72
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.26	□□□□□ -1.73
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.24	□□□□□ -1.73
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.22	□□□□□ -1.73
GTPBP3-216	ENST00000598038	MT3	P25713	68 aa		4.06	□□□□□ -1.76
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4	□□□□□ -1.77
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.94	□□□□□ -1.78
GTPBP3-216	ENST00000598038	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.93	□□□□□ -1.78
GTPBP3-216	ENST00000598038	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.77	□□□□□ -1.81
GTPBP3-216	ENST00000598038	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.69	□□□□□ -1.82
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.68	□□□□□ -1.82
GTPBP3-216	ENST00000598038	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		3.67	□□□□□ -1.82
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.6	□□□□□ -1.83
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.57	□□□□□ -1.84
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.56	□□□□□ -1.84
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.53	□□□□□ -1.84
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.51	□□□□□ -1.85
GTPBP3-216	ENST00000598038	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.48	□□□□□ -1.85
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.37	□□□□□ -1.87
GTPBP3-216	ENST00000598038	LCE1C	Q5T751	118 aa		3.23	□□□□□ -1.89
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.17	□□□□□ -1.9
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.16	□□□□□ -1.9
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.12	□□□□□ -1.91
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.96	□□□□□ -1.93
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.96	□□□□□ -1.93
GTPBP3-216	ENST00000598038	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.96	□□□□□ -1.94
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.85	□□□□□ -1.95
GTPBP3-216	ENST00000598038	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.74	□□□□□ -1.97
GTPBP3-216	ENST00000598038	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.49	□□□□□ -2.01
GTPBP3-216	ENST00000598038	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.53	□□□□□ -2.17

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