RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590367.5

EFTUD2-218, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2

Gene EFTUD2, Length 3,638 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.75□□□□□ -1.97
EFTUD2-218ENST00000590367 KMT2DO14686 5537 aa2.73□□□□□ -1.97
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.73□□□□□ -1.97
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.71□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 NEBP20929 6669 aa2.7□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.7□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR2EP22531 72 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR2BP35325 72 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR2AP35326 72 aa2.69□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa2.68□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 MDN1Q9NU22 5596 aa2.67□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP12-4P60329 112 aa2.65□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa2.65□□□□□ -1.98
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-9P26371 169 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-218ENST00000590367 LOC100996750A0A140TA64 210 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.64□□□□□ -1.99
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.62□□□□□ -1.99
EFTUD2-218ENST00000590367 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.61□□□□□ -1.99
EFTUD2-218ENST00000590367 SPRR2DP22532 72 aa2.6□□□□□ -1.99
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-218ENST00000590367 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.56□□□□□ -2
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.54□□□□□ -2
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.5□□□□□ -2.01
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE3BQ5TA77 95 aa2.5□□□□□ -2.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1EP04732 61 aa2.47□□□□□ -2.01
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1LQ93083 61 aa2.46□□□□□ -2.02
EFTUD2-218ENST00000590367 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
EFTUD2-218ENST00000590367 PRM1P04553 51 aa2.4□□□□□ -2.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1GP13640 62 aa2.39□□□□□ -2.03
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.38□□□□□ -2.03
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.35□□□□□ -2.03
EFTUD2-218ENST00000590367 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.34□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.32□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1MQ8N339 61 aa2.32□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MT4P47944 62 aa2.32□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 MT1AP04731 61 aa2.29□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.29□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE1EQ5T753 118 aa2.29□□□□□ -2.04
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE1DQ5T752 114 aa2.26□□□□□ -2.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE4AQ5TA78 99 aa2.21□□□□□ -2.06
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE1FQ5T754 118 aa2.2□□□□□ -2.06
EFTUD2-218ENST00000590367 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.17□□□□□ -2.06
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.14□□□□□ -2.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.1□□□□□ -2.07
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.09□□□□□ -2.07
EFTUD2-218ENST00000590367 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.08□□□□□ -2.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.08□□□□□ -2.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.05□□□□□ -2.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.04□□□□□ -2.08
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.03□□□□□ -2.09
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.98□□□□□ -2.09
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.95□□□□□ -2.1
EFTUD2-218ENST00000590367 MT3P25713 68 aa1.95□□□□□ -2.1
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.94□□□□□ -2.1
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa1.9□□□□□ -2.11
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.81□□□□□ -2.12
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-8O75690 187 aa1.81□□□□□ -2.12
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.75□□□□□ -2.13
EFTUD2-218ENST00000590367 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.75□□□□□ -2.13
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC5ACP98088 5654 aa1.72□□□□□ -2.13
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.69□□□□□ -2.14
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.66□□□□□ -2.14
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.55□□□□□ -2.16
EFTUD2-218ENST00000590367 LCE1CQ5T751 118 aa1.55□□□□□ -2.16
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.35□□□□□ -2.19
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.33□□□□□ -2.2
EFTUD2-218ENST00000590367 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.3□□□□□ -2.2
EFTUD2-218ENST00000590367 PHGR1C9JFL3 82 aa1.28□□□□□ -2.21
EFTUD2-218ENST00000590367 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.76□□□□□ -2.29
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.8 ms