RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584243.5

GGA3-218, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 3

Gene GGA3, Length 646 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.76□□□□□ -1.81
GGA3-218ENST00000584243 LCE4AQ5TA78 99 aa3.73□□□□□ -1.81
GGA3-218ENST00000584243 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.72□□□□□ -1.81
GGA3-218ENST00000584243 PP632Q6XCG6 107 aa3.72□□□□□ -1.81
GGA3-218ENST00000584243 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.71□□□□□ -1.82
GGA3-218ENST00000584243 SPRR2DP22532 72 aa3.7□□□□□ -1.82
GGA3-218ENST00000584243 LCE3BQ5TA77 95 aa3.69□□□□□ -1.82
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.68□□□□□ -1.82
GGA3-218ENST00000584243 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.65□□□□□ -1.83
GGA3-218ENST00000584243 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.64□□□□□ -1.83
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.63□□□□□ -1.83
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.63□□□□□ -1.83
GGA3-218ENST00000584243 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
GGA3-218ENST00000584243 TNP1P09430 55 aa3.55□□□□□ -1.84
GGA3-218ENST00000584243 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.55□□□□□ -1.84
GGA3-218ENST00000584243 LCE1DQ5T752 114 aa3.54□□□□□ -1.84
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.52□□□□□ -1.85
GGA3-218ENST00000584243 PLAC4Q8WY50 150 aa3.52□□□□□ -1.85
GGA3-218ENST00000584243 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.52□□□□□ -1.85
GGA3-218ENST00000584243 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.49□□□□□ -1.85
GGA3-218ENST00000584243 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.46□□□□□ -1.86
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-5P60370 271 aa3.44□□□□□ -1.86
GGA3-218ENST00000584243 LUZP6Q538Z0 58 aa3.44□□□□□ -1.86
GGA3-218ENST00000584243 MUC5ACP98088 5654 aa3.42□□□□□ -1.86
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.39□□□□□ -1.87
GGA3-218ENST00000584243 MT1BP07438 61 aa3.38□□□□□ -1.87
GGA3-218ENST00000584243 NDUFAF8A1L188 74 aa3.36□□□□□ -1.87
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.36□□□□□ -1.87
GGA3-218ENST00000584243 MT4P47944 62 aa3.35□□□□□ -1.87
GGA3-218ENST00000584243 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.34□□□□□ -1.87
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.29□□□□□ -1.88
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.26□□□□□ -1.89
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.23□□□□□ -1.89
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-12P60413 245 aa3.19□□□□□ -1.9
GGA3-218ENST00000584243 LCE3AQ5TA76 89 aa3.17□□□□□ -1.9
GGA3-218ENST00000584243 MT1XP80297 61 aa3.16□□□□□ -1.9
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP12-3P60328 96 aa3.12□□□□□ -1.91
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.05□□□□□ -1.92
GGA3-218ENST00000584243 INE1O15225 51 aa2.99□□□□□ -1.93
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
GGA3-218ENST00000584243 MT3P25713 68 aa2.98□□□□□ -1.93
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-8O75690 187 aa2.96□□□□□ -1.94
GGA3-218ENST00000584243 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.93□□□□□ -1.94
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.92□□□□□ -1.94
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.91□□□□□ -1.94
GGA3-218ENST00000584243 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.81□□□□□ -1.96
GGA3-218ENST00000584243 MT1EP04732 61 aa2.78□□□□□ -1.96
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.78□□□□□ -1.96
GGA3-218ENST00000584243 MT1LQ93083 61 aa2.76□□□□□ -1.97
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.75□□□□□ -1.97
GGA3-218ENST00000584243 MT1GP13640 62 aa2.7□□□□□ -1.98
GGA3-218ENST00000584243 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.69□□□□□ -1.98
GGA3-218ENST00000584243 LCE1FQ5T754 118 aa2.65□□□□□ -1.99
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.63□□□□□ -1.99
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.62□□□□□ -1.99
GGA3-218ENST00000584243 MT1MQ8N339 61 aa2.59□□□□□ -1.99
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP12-4P60329 112 aa2.52□□□□□ -2.01
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.44□□□□□ -2.02
GGA3-218ENST00000584243 MT1AP04731 61 aa2.43□□□□□ -2.02
GGA3-218ENST00000584243 LCE1EQ5T753 118 aa2.4□□□□□ -2.03
GGA3-218ENST00000584243 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.27□□□□□ -2.05
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.26□□□□□ -2.05
GGA3-218ENST00000584243 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.25□□□□□ -2.05
GGA3-218ENST00000584243 PHGR1C9JFL3 82 aa2.22□□□□□ -2.05
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.18□□□□□ -2.06
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.14□□□□□ -2.07
GGA3-218ENST00000584243 PRM1P04553 51 aa2.01□□□□□ -2.09
GGA3-218ENST00000584243 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.87□□□□□ -2.11
GGA3-218ENST00000584243 LCE1CQ5T751 118 aa1.77□□□□□ -2.13
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.75□□□□□ -2.13
GGA3-218ENST00000584243 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.73□□□□□ -2.13
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.67□□□□□ -2.14
GGA3-218ENST00000584243 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.49□□□□□ -2.17
GGA3-218ENST00000584243 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.09□□□□□ -2.23
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 1038.8 ms