RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576390.5

P4HB-223, Transcript of prolyl 4-hydroxylase subunit beta, human

TSL 4 BASIC

Gene P4HB, Length 439 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
P4HB-223	ENST00000576390	LCE1D	Q5T752	114 aa		6.86	□□□□□ -1.31
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		6.85	□□□□□ -1.31
P4HB-223	ENST00000576390	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		6.83	□□□□□ -1.32
P4HB-223	ENST00000576390	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		6.83	□□□□□ -1.32
P4HB-223	ENST00000576390	PP632	Q6XCG6	107 aa		6.79	□□□□□ -1.32
P4HB-223	ENST00000576390	LCE4A	Q5TA78	99 aa		6.78	□□□□□ -1.32
P4HB-223	ENST00000576390	TNP1	P09430	55 aa		6.76	□□□□□ -1.33
P4HB-223	ENST00000576390	MT1M	Q8N339	61 aa		6.76	□□□□□ -1.33
P4HB-223	ENST00000576390	BRK1	Q8WUW1	75 aa		6.76	□□□□□ -1.33
P4HB-223	ENST00000576390	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		6.74	□□□□□ -1.33
P4HB-223	ENST00000576390		K7ERS5	55 aa		6.72	□□□□□ -1.33
P4HB-223	ENST00000576390	MT1L	Q93083	61 aa		6.72	□□□□□ -1.33
P4HB-223	ENST00000576390	MT4	P47944	62 aa		6.71	□□□□□ -1.34
P4HB-223	ENST00000576390	PRO0628	Q9UI54	55 aa		6.66	□□□□□ -1.34
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		6.65	□□□□□ -1.34
P4HB-223	ENST00000576390	LCE3A	Q5TA76	89 aa		6.63	□□□□□ -1.35
P4HB-223	ENST00000576390	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		6.62	□□□□□ -1.35
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		6.6	□□□□□ -1.35
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		6.53	□□□□□ -1.36
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		6.53	□□□□□ -1.36
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		6.5	□□□□□ -1.37
P4HB-223	ENST00000576390	PMAIP1	Q13794	54 aa		6.45	□□□□□ -1.38
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP12-3	P60328	96 aa		6.37	□□□□□ -1.39
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		6.37	□□□□□ -1.39
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		6.32	□□□□□ -1.4
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		6.31	□□□□□ -1.4
P4HB-223	ENST00000576390	ROMO1	P60602	79 aa		6.3	□□□□□ -1.4
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		6.26	□□□□□ -1.41
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		6.23	□□□□□ -1.41
P4HB-223	ENST00000576390	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		6.21	□□□□□ -1.42
P4HB-223	ENST00000576390	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		6.16	□□□□□ -1.42
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP12-4	P60329	112 aa		6.1	□□□□□ -1.43
P4HB-223	ENST00000576390	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	6.08	□□□□□ -1.44
P4HB-223	ENST00000576390	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.05	□□□□□ -1.44
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		6.04	□□□□□ -1.44
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		5.96	□□□□□ -1.46
P4HB-223	ENST00000576390	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		5.88	□□□□□ -1.47
P4HB-223	ENST00000576390	SVIP	Q8NHG7	77 aa		5.88	□□□□□ -1.47
P4HB-223	ENST00000576390	PRAC1	Q96KF2	57 aa		5.88	□□□□□ -1.47
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		5.78	□□□□□ -1.48
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		5.78	□□□□□ -1.48
P4HB-223	ENST00000576390	MT1A	P04731	61 aa		5.72	□□□□□ -1.49
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		5.7	□□□□□ -1.5
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-8	O75690	187 aa		5.61	□□□□□ -1.51
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		5.55	□□□□□ -1.52
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		5.53	□□□□□ -1.52
P4HB-223	ENST00000576390	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	5.5	□□□□□ -1.53
P4HB-223	ENST00000576390	MUC5AC	P98088	5654 aa		5.48	□□□□□ -1.53
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		5.48	□□□□□ -1.53
P4HB-223	ENST00000576390	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
P4HB-223	ENST00000576390	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		5.45	□□□□□ -1.54
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		5.33	□□□□□ -1.56
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		5.23	□□□□□ -1.57
P4HB-223	ENST00000576390	MT3	P25713	68 aa		5.22	□□□□□ -1.57
P4HB-223	ENST00000576390	LUZP6	Q538Z0	58 aa		5.06	□□□□□ -1.6
P4HB-223	ENST00000576390	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.89	□□□□□ -1.63
P4HB-223	ENST00000576390	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.7	□□□□□ -1.66
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		4.66	□□□□□ -1.66
P4HB-223	ENST00000576390	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		4.57	□□□□□ -1.68
P4HB-223	ENST00000576390	LCE1C	Q5T751	118 aa		4.54	□□□□□ -1.68
P4HB-223	ENST00000576390	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		4.3	□□□□□ -1.72
P4HB-223	ENST00000576390		A0A0A0MQY5	61 aa		4.29	□□□□□ -1.72
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		4.27	□□□□□ -1.73
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		4.14	□□□□□ -1.75
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
P4HB-223	ENST00000576390	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		4.1	□□□□□ -1.75
P4HB-223	ENST00000576390	LCE1F	Q5T754	118 aa		4.1	□□□□□ -1.75
P4HB-223	ENST00000576390	INE1	O15225	51 aa		4.06	□□□□□ -1.76
P4HB-223	ENST00000576390		H3BS24	57 aa		3.96	□□□□□ -1.78
P4HB-223	ENST00000576390	PHGR1	C9JFL3	82 aa		3.78	□□□□□ -1.8
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		3.77	□□□□□ -1.81
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		3.46	□□□□□ -1.86
P4HB-223	ENST00000576390	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		3.37	□□□□□ -1.87
P4HB-223	ENST00000576390	PRM1	P04553	51 aa		3.26	□□□□□ -1.89
P4HB-223	ENST00000576390	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		2.88	□□□□□ -1.95
P4HB-223	ENST00000576390	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		2.43	□□□□□ -2.02

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