RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551473.5

CS-228, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-228ENST00000551473 KRTAP12-1P59990 96 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-228ENST00000551473 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.87□□□□□ -1.79
CS-228ENST00000551473 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-228ENST00000551473 PRO0628Q9UI54 55 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-228ENST00000551473 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GU33 70 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-228ENST00000551473 KRTAP12-3P60328 96 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-228ENST00000551473 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-228ENST00000551473 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
CS-228ENST00000551473 J3QR89 54 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 KRTAP5-8O75690 187 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 MUC5ACP98088 5654 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.74□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.74□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 SNURFQ9Y675 71 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.72□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.72□□□□□ -1.81
CS-228ENST00000551473 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-228ENST00000551473 ANAPC13Q9BS18 74 aa3.71□□□□□ -1.82
CS-228ENST00000551473 H3BS24 57 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-228ENST00000551473 COA5Q86WW8 74 aa3.69□□□□□ -1.82
CS-228ENST00000551473 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-228ENST00000551473 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-228ENST00000551473 PMAIP1Q13794 54 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-228ENST00000551473 A0A0A0MQY5 61 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-228ENST00000551473 A8MU10 97 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-228ENST00000551473 SERP2Q8N6R1 65 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-228ENST00000551473 MT1AP04731 61 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-228ENST00000551473 A0A1B0GU69 56 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-228ENST00000551473 TMEM258P61165 79 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-228ENST00000551473 CCDC179H3BU77 68 aa3.55□□□□□ -1.84
CS-228ENST00000551473 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-228ENST00000551473 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-228ENST00000551473 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-228ENST00000551473 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.48□□□□□ -1.85
CS-228ENST00000551473 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.48□□□□□ -1.85
CS-228ENST00000551473 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-228ENST00000551473 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-228ENST00000551473 COX7CP15954 63 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-228ENST00000551473 BRK1Q8WUW1 75 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-228ENST00000551473 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-228ENST00000551473 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.4□□□□□ -1.87
CS-228ENST00000551473 PSPHP1O15172 72 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-228ENST00000551473 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
CS-228ENST00000551473 PRR15LQ9BU68 103 aa3.38□□□□□ -1.87
CS-228ENST00000551473 MT3P25713 68 aa3.31□□□□□ -1.88
CS-228ENST00000551473 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.3□□□□□ -1.88
CS-228ENST00000551473 H7BZZ5 65 aa3.29□□□□□ -1.88
CS-228ENST00000551473 Q1T7F1 81 aa3.22□□□□□ -1.89
CS-228ENST00000551473 UQCR11O14957 56 aa3.21□□□□□ -1.9
CS-228ENST00000551473 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.2□□□□□ -1.9
CS-228ENST00000551473 K7ERS5 55 aa3.18□□□□□ -1.9
CS-228ENST00000551473 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.16□□□□□ -1.9
CS-228ENST00000551473 LCE1EQ5T753 118 aa3.14□□□□□ -1.91
CS-228ENST00000551473 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.07□□□□□ -1.92
CS-228ENST00000551473 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.07□□□□□ -1.92
CS-228ENST00000551473 ROMO1P60602 79 aa3□□□□□ -1.93
CS-228ENST00000551473 LUZP6Q538Z0 58 aa3□□□□□ -1.93
CS-228ENST00000551473 PRAC1Q96KF2 57 aa2.99□□□□□ -1.93
CS-228ENST00000551473 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.97□□□□□ -1.93
CS-228ENST00000551473 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.96□□□□□ -1.94
CS-228ENST00000551473 A6NED7 52 aa2.95□□□□□ -1.94
CS-228ENST00000551473 LCE1CQ5T751 118 aa2.91□□□□□ -1.94
CS-228ENST00000551473 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.82□□□□□ -1.96
CS-228ENST00000551473 NDUFAF8A1L188 74 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-228ENST00000551473 LCE1FQ5T754 118 aa2.74□□□□□ -1.97
CS-228ENST00000551473 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.72□□□□□ -1.97
CS-228ENST00000551473 PHGR1C9JFL3 82 aa2.66□□□□□ -1.98
CS-228ENST00000551473 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.59□□□□□ -1.99
CS-228ENST00000551473 INE1O15225 51 aa2.46□□□□□ -2.02
CS-228ENST00000551473 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.41□□□□□ -2.02
CS-228ENST00000551473 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.33□□□□□ -2.04
CS-228ENST00000551473 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.2□□□□□ -2.06
CS-228ENST00000551473 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-228ENST00000551473 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-228ENST00000551473 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-228ENST00000551473 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.51□□□□□ -2.17
CS-228ENST00000551473 PRM1P04553 51 aa1.38□□□□□ -2.19
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