RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547912.1

CS-210, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 674 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-210ENST00000547912 A8MU10 97 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-210ENST00000547912 K7ERS5 55 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-210ENST00000547912 KRTAP12-1P59990 96 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-210ENST00000547912 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-210ENST00000547912 A6NED7 52 aa2.21□□□□□ -2.06
CS-210ENST00000547912 KRTAP12-2P59991 146 aa2.21□□□□□ -2.06
CS-210ENST00000547912 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.19□□□□□ -2.06
CS-210ENST00000547912 LCE1FQ5T754 118 aa2.18□□□□□ -2.06
CS-210ENST00000547912 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.17□□□□□ -2.06
CS-210ENST00000547912 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
CS-210ENST00000547912 TNP1P09430 55 aa2.15□□□□□ -2.07
CS-210ENST00000547912 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa2.13□□□□□ -2.07
CS-210ENST00000547912 SPRR2FQ96RM1 72 aa2.11□□□□□ -2.07
CS-210ENST00000547912 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
CS-210ENST00000547912 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.1□□□□□ -2.07
CS-210ENST00000547912 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa2.09□□□□□ -2.07
CS-210ENST00000547912 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa2.08□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 SPRR2EP22531 72 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 SPRR2BP35325 72 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 SPRR2AP35326 72 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 ROMO1P60602 79 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 LCE3CQ5T5A8 94 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.05□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 BRK1Q8WUW1 75 aa2.04□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 LCE3AQ5TA76 89 aa2.03□□□□□ -2.08
CS-210ENST00000547912 KMT2DO14686 5537 aa2.02□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.01□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.01□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 MT1EP04732 61 aa2□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 PP632Q6XCG6 107 aa2□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 SPRR2DP22532 72 aa1.99□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP12-3P60328 96 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa1.98□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-210ENST00000547912 NEBP20929 6669 aa1.96□□□□□ -2.1
CS-210ENST00000547912 MT1GP13640 62 aa1.95□□□□□ -2.1
CS-210ENST00000547912 MDN1Q9NU22 5596 aa1.93□□□□□ -2.1
CS-210ENST00000547912 PMAIP1Q13794 54 aa1.93□□□□□ -2.1
CS-210ENST00000547912 MT1LQ93083 61 aa1.93□□□□□ -2.1
CS-210ENST00000547912 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa1.91□□□□□ -2.1
CS-210ENST00000547912 MT1MQ8N339 61 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-210ENST00000547912 PRO0628Q9UI54 55 aa1.89□□□□□ -2.11
CS-210ENST00000547912 LCE3EQ5T5B0 92 aa1.86□□□□□ -2.11
CS-210ENST00000547912 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP1.82□□□□□ -2.12
CS-210ENST00000547912 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.79□□□□□ -2.12
CS-210ENST00000547912 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP1.79□□□□□ -2.12
CS-210ENST00000547912 LCE1CQ5T751 118 aa1.78□□□□□ -2.12
CS-210ENST00000547912 LCE1BQ5T7P3 118 aa1.78□□□□□ -2.12
CS-210ENST00000547912 LUZP6Q538Z0 58 aa1.73□□□□□ -2.13
CS-210ENST00000547912 MT4P47944 62 aa1.72□□□□□ -2.13
CS-210ENST00000547912 KRTAP12-4P60329 112 aa1.7□□□□□ -2.14
CS-210ENST00000547912 KRTAP5-8O75690 187 aa1.67□□□□□ -2.14
CS-210ENST00000547912 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa1.66□□□□□ -2.14
CS-210ENST00000547912 MT1AP04731 61 aa1.66□□□□□ -2.14
CS-210ENST00000547912 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa1.63□□□□□ -2.15
CS-210ENST00000547912 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.61□□□□□ -2.15
CS-210ENST00000547912 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.57□□□□□ -2.16
CS-210ENST00000547912 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.53□□□□□ -2.16
CS-210ENST00000547912 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.51□□□□□ -2.17
CS-210ENST00000547912 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP1.5□□□□□ -2.17
CS-210ENST00000547912 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.46□□□□□ -2.18
CS-210ENST00000547912 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.46□□□□□ -2.18
CS-210ENST00000547912 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.45□□□□□ -2.18
CS-210ENST00000547912 LCE3DQ9BYE3 92 aa1.42□□□□□ -2.18
CS-210ENST00000547912 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.4□□□□□ -2.18
CS-210ENST00000547912 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.25□□□□□ -2.21
CS-210ENST00000547912 MUC5ACP98088 5654 aa1.18□□□□□ -2.22
CS-210ENST00000547912 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.16□□□□□ -2.22
CS-210ENST00000547912 INE1O15225 51 aa1.14□□□□□ -2.23
CS-210ENST00000547912 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
CS-210ENST00000547912 PRM1P04553 51 aa1.03□□□□□ -2.24
CS-210ENST00000547912 PHGR1C9JFL3 82 aa0.97□□□□□ -2.25
CS-210ENST00000547912 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.7□□□□□ -2.3
CS-210ENST00000547912 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.61□□□□□ -2.31
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms