RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547449.1

CS-209, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 434 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-209ENST00000547449 LCE1DQ5T752 114 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-209ENST00000547449 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-209ENST00000547449 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.55□□□□□ -1.84
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CS-209ENST00000547449 MT1LQ93083 61 aa3.47□□□□□ -1.85
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CS-209ENST00000547449 LUZP6Q538Z0 58 aa3.43□□□□□ -1.86
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CS-209ENST00000547449 SPRR2DP22532 72 aa3.09□□□□□ -1.91
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CS-209ENST00000547449 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.08□□□□□ -1.92
CS-209ENST00000547449 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.08□□□□□ -1.92
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CS-209ENST00000547449 INE1O15225 51 aa2.84□□□□□ -1.95
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CS-209ENST00000547449 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.79□□□□□ -1.96
CS-209ENST00000547449 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.78□□□□□ -1.96
CS-209ENST00000547449 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.78□□□□□ -1.96
CS-209ENST00000547449 KRTAP12-4P60329 112 aa2.77□□□□□ -1.97
CS-209ENST00000547449 MT3P25713 68 aa2.69□□□□□ -1.98
CS-209ENST00000547449 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.67□□□□□ -1.98
CS-209ENST00000547449 MT4P47944 62 aa2.66□□□□□ -1.98
CS-209ENST00000547449 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.64□□□□□ -1.99
CS-209ENST00000547449 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.61□□□□□ -1.99
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CS-209ENST00000547449 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.56□□□□□ -2
CS-209ENST00000547449 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.46□□□□□ -2.02
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CS-209ENST00000547449 LCE1EQ5T753 118 aa2.34□□□□□ -2.03
CS-209ENST00000547449 LCE1FQ5T754 118 aa2.29□□□□□ -2.04
CS-209ENST00000547449 PRM1P04553 51 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-209ENST00000547449 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.23□□□□□ -2.05
CS-209ENST00000547449 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.22□□□□□ -2.05
CS-209ENST00000547449 KRTAP5-8O75690 187 aa2.19□□□□□ -2.06
CS-209ENST00000547449 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.19□□□□□ -2.06
CS-209ENST00000547449 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.17□□□□□ -2.06
CS-209ENST00000547449 LCE1CQ5T751 118 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-209ENST00000547449 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-209ENST00000547449 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.16□□□□□ -2.06
CS-209ENST00000547449 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
CS-209ENST00000547449 MUC5ACP98088 5654 aa2.06□□□□□ -2.08
CS-209ENST00000547449 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.97□□□□□ -2.09
CS-209ENST00000547449 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.92□□□□□ -2.1
CS-209ENST00000547449 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa1.78□□□□□ -2.12
CS-209ENST00000547449 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.78□□□□□ -2.12
CS-209ENST00000547449 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.65□□□□□ -2.14
CS-209ENST00000547449 PHGR1C9JFL3 82 aa1.63□□□□□ -2.15
CS-209ENST00000547449 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.4□□□□□ -2.19
CS-209ENST00000547449 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.37□□□□□ -2.19
CS-209ENST00000547449 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.05□□□□□ -2.24
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