RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		4.67	□□□□□ -1.66
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR15L	Q9BU68	103 aa		4.66	□□□□□ -1.66
RBBP4-215	ENST00000524393	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
RBBP4-215	ENST00000524393		A8MU10	97 aa		4.64	□□□□□ -1.67
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		4.6	□□□□□ -1.67
RBBP4-215	ENST00000524393	TNP1	P09430	55 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-215	ENST00000524393	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.58	□□□□□ -1.68
RBBP4-215	ENST00000524393	MT1G	P13640	62 aa		4.56	□□□□□ -1.68
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.55	□□□□□ -1.68
RBBP4-215	ENST00000524393	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		4.53	□□□□□ -1.68
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.52	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	PRO0628	Q9UI54	55 aa		4.51	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM258	P61165	79 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE3A	Q5TA76	89 aa		4.5	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	UQCR11	O14957	56 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	MT1L	Q93083	61 aa		4.47	□□□□□ -1.69
RBBP4-215	ENST00000524393	MT1M	Q8N339	61 aa		4.46	□□□□□ -1.7
RBBP4-215	ENST00000524393	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
RBBP4-215	ENST00000524393	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		4.36	□□□□□ -1.71
RBBP4-215	ENST00000524393		K7ERS5	55 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP12-3	P60328	96 aa		4.35	□□□□□ -1.71
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		4.33	□□□□□ -1.72
RBBP4-215	ENST00000524393	MT4	P47944	62 aa		4.32	□□□□□ -1.72
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		4.3	□□□□□ -1.72
RBBP4-215	ENST00000524393	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.28	□□□□□ -1.72
RBBP4-215	ENST00000524393	PSPHP1	O15172	72 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.25	□□□□□ -1.73
RBBP4-215	ENST00000524393	GPR98	Q8WXG9	6306 aa		4.23	□□□□□ -1.73
RBBP4-215	ENST00000524393		Q1T7F1	81 aa		4.22	□□□□□ -1.73
RBBP4-215	ENST00000524393	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		4.18	□□□□□ -1.74
RBBP4-215	ENST00000524393		A6NED7	52 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RBBP4-215	ENST00000524393	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RBBP4-215	ENST00000524393	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		4.08	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP12-4	P60329	112 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RBBP4-215	ENST00000524393	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		4.01	□□□□□ -1.77
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		4	□□□□□ -1.77
RBBP4-215	ENST00000524393	ROMO1	P60602	79 aa		3.98	□□□□□ -1.77
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.89	□□□□□ -1.79
RBBP4-215	ENST00000524393	MT1A	P04731	61 aa		3.82	□□□□□ -1.8
RBBP4-215	ENST00000524393	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.81	□□□□□ -1.8
RBBP4-215	ENST00000524393	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.79	□□□□□ -1.8
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		3.77	□□□□□ -1.81
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.71	□□□□□ -1.82
RBBP4-215	ENST00000524393	MT3	P25713	68 aa		3.65	□□□□□ -1.83
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		3.62	□□□□□ -1.83
RBBP4-215	ENST00000524393	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.58	□□□□□ -1.84
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RBBP4-215	ENST00000524393	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		3.44	□□□□□ -1.86
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		3.42	□□□□□ -1.86
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	3.42	□□□□□ -1.86
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE1E	Q5T753	118 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBBP4-215	ENST00000524393	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.35	□□□□□ -1.87
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		3.33	□□□□□ -1.88
RBBP4-215	ENST00000524393	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RBBP4-215	ENST00000524393	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE1F	Q5T754	118 aa		3.26	□□□□□ -1.89
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.89	□□□□□ -1.95
RBBP4-215	ENST00000524393	INE1	O15225	51 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-215	ENST00000524393	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.48	□□□□□ -2.01
RBBP4-215	ENST00000524393	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.38	□□□□□ -2.03
RBBP4-215	ENST00000524393	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		2.1	□□□□□ -2.07
RBBP4-215	ENST00000524393	PRM1	P04553	51 aa		2.02	□□□□□ -2.09
RBBP4-215	ENST00000524393	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.82	□□□□□ -2.12
RBBP4-215	ENST00000524393	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.48	□□□□□ -2.17

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