RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512343.5

RASGEF1B-209, Transcript of RasGEF domain family member 1B, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RASGEF1B, Length 498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RASGEF1B-209ENST00000512343 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.44□□□□□ -1.22
RASGEF1B-209ENST00000512343 A0A1B0GU69 56 aa7.39□□□□□ -1.23
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.38□□□□□ -1.23
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.37□□□□□ -1.23
RASGEF1B-209ENST00000512343 H7BZZ5 65 aa7.35□□□□□ -1.23
RASGEF1B-209ENST00000512343 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.33□□□□□ -1.24
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa7.3□□□□□ -1.24
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP12-3P60328 96 aa7.29□□□□□ -1.24
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
RASGEF1B-209ENST00000512343 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.16□□□□□ -1.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 CCDC179H3BU77 68 aa7.16□□□□□ -1.26
RASGEF1B-209ENST00000512343 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.1□□□□□ -1.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP12-4P60329 112 aa7.09□□□□□ -1.27
RASGEF1B-209ENST00000512343 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.07□□□□□ -1.28
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRR15LQ9BU68 103 aa6.99□□□□□ -1.29
RASGEF1B-209ENST00000512343 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.29
RASGEF1B-209ENST00000512343 TMEM258P61165 79 aa6.96□□□□□ -1.3
RASGEF1B-209ENST00000512343 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.89□□□□□ -1.31
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.82□□□□□ -1.32
RASGEF1B-209ENST00000512343 UQCR11O14957 56 aa6.78□□□□□ -1.32
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.74□□□□□ -1.33
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.69□□□□□ -1.34
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.68□□□□□ -1.34
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.67□□□□□ -1.34
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.66□□□□□ -1.34
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.64□□□□□ -1.35
RASGEF1B-209ENST00000512343 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.62□□□□□ -1.35
RASGEF1B-209ENST00000512343 MT1AP04731 61 aa6.61□□□□□ -1.35
RASGEF1B-209ENST00000512343 V9GYY9 64 aa6.58□□□□□ -1.36
RASGEF1B-209ENST00000512343 Q1T7F1 81 aa6.55□□□□□ -1.36
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-8O75690 187 aa6.54□□□□□ -1.36
RASGEF1B-209ENST00000512343 PCP4P48539 62 aa6.52□□□□□ -1.37
RASGEF1B-209ENST00000512343 K7ERS5 55 aa6.5□□□□□ -1.37
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.49□□□□□ -1.37
RASGEF1B-209ENST00000512343 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.43□□□□□ -1.38
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.41□□□□□ -1.38
RASGEF1B-209ENST00000512343 PSPHP1O15172 72 aa6.4□□□□□ -1.38
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.38□□□□□ -1.39
RASGEF1B-209ENST00000512343 MUC5ACP98088 5654 aa6.37□□□□□ -1.39
RASGEF1B-209ENST00000512343 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.35□□□□□ -1.39
RASGEF1B-209ENST00000512343 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
RASGEF1B-209ENST00000512343 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.24□□□□□ -1.41
RASGEF1B-209ENST00000512343 A6NED7 52 aa6.21□□□□□ -1.42
RASGEF1B-209ENST00000512343 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.14□□□□□ -1.43
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa6.06□□□□□ -1.44
RASGEF1B-209ENST00000512343 MT3P25713 68 aa6.04□□□□□ -1.44
RASGEF1B-209ENST00000512343 ROMO1P60602 79 aa6.03□□□□□ -1.44
RASGEF1B-209ENST00000512343 SVIPQ8NHG7 77 aa5.98□□□□□ -1.45
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE1EQ5T753 118 aa5.6□□□□□ -1.51
RASGEF1B-209ENST00000512343 BRK1Q8WUW1 75 aa5.58□□□□□ -1.52
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.41□□□□□ -1.54
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.4□□□□□ -1.54
RASGEF1B-209ENST00000512343 PMAIP1Q13794 54 aa5.31□□□□□ -1.56
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE1CQ5T751 118 aa5.22□□□□□ -1.57
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRO0628Q9UI54 55 aa5.14□□□□□ -1.59
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.1□□□□□ -1.59
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRAC1Q96KF2 57 aa4.98□□□□□ -1.61
RASGEF1B-209ENST00000512343 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.83□□□□□ -1.64
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.76□□□□□ -1.65
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.72□□□□□ -1.65
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE1FQ5T754 118 aa4.68□□□□□ -1.66
RASGEF1B-209ENST00000512343 PHGR1C9JFL3 82 aa4.48□□□□□ -1.69
RASGEF1B-209ENST00000512343 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.37□□□□□ -1.71
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.36□□□□□ -1.71
RASGEF1B-209ENST00000512343 H3BS24 57 aa4.27□□□□□ -1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 LUZP6Q538Z0 58 aa4.24□□□□□ -1.73
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.13□□□□□ -1.75
RASGEF1B-209ENST00000512343 A0A0A0MQY5 61 aa4.02□□□□□ -1.77
RASGEF1B-209ENST00000512343 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.91□□□□□ -1.78
RASGEF1B-209ENST00000512343 NDUFAF8A1L188 74 aa3.57□□□□□ -1.84
RASGEF1B-209ENST00000512343 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.35□□□□□ -1.87
RASGEF1B-209ENST00000512343 PRM1P04553 51 aa3.1□□□□□ -1.91
RASGEF1B-209ENST00000512343 INE1O15225 51 aa3□□□□□ -1.93
RASGEF1B-209ENST00000512343 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.4 ms