RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495785.1

SRSF10-215, Transcript of serine and arginine rich splicing factor 10, humanhuman

TSL 5

Gene SRSF10, Length 1,390 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF10-215ENST00000495785 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.47□□□□□ -1.85
SRSF10-215ENST00000495785 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.47□□□□□ -1.85
SRSF10-215ENST00000495785 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
SRSF10-215ENST00000495785 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
SRSF10-215ENST00000495785 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.45□□□□□ -1.86
SRSF10-215ENST00000495785 Q8N9L7 120 aa3.43□□□□□ -1.86
SRSF10-215ENST00000495785 A0A1B0GU33 70 aa3.4□□□□□ -1.86
SRSF10-215ENST00000495785 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.39□□□□□ -1.87
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.38□□□□□ -1.87
SRSF10-215ENST00000495785 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.38□□□□□ -1.87
SRSF10-215ENST00000495785 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.37□□□□□ -1.87
SRSF10-215ENST00000495785 ACYP2P14621 99 aa3.37□□□□□ -1.87
SRSF10-215ENST00000495785 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
SRSF10-215ENST00000495785 K7EQZ3 153 aa3.34□□□□□ -1.88
SRSF10-215ENST00000495785 MT1BP07438 61 aa3.29□□□□□ -1.88
SRSF10-215ENST00000495785 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.27□□□□□ -1.89
SRSF10-215ENST00000495785 NEBP20929 6669 aa3.26□□□□□ -1.89
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.25□□□□□ -1.89
SRSF10-215ENST00000495785 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.24□□□□□ -1.89
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.24□□□□□ -1.89
SRSF10-215ENST00000495785 S4R3F8 94 aa3.23□□□□□ -1.89
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.19□□□□□ -1.9
SRSF10-215ENST00000495785 R4GN34 69 aa3.16□□□□□ -1.9
SRSF10-215ENST00000495785 KMT2DO14686 5537 aa3.16□□□□□ -1.9
SRSF10-215ENST00000495785 CRIPTQ9P021 101 aa3.15□□□□□ -1.9
SRSF10-215ENST00000495785 MDN1Q9NU22 5596 aa3.13□□□□□ -1.91
SRSF10-215ENST00000495785 PLAC4Q8WY50 150 aa3.12□□□□□ -1.91
SRSF10-215ENST00000495785 INE1O15225 51 aa3.11□□□□□ -1.91
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.08□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.08□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 H0YAA0 97 aa3.07□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.06□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 MT1XP80297 61 aa3.05□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR2EP22531 72 aa3.04□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR2BP35325 72 aa3.04□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR2AP35326 72 aa3.04□□□□□ -1.92
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3□□□□□ -1.93
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa2.98□□□□□ -1.93
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR2DP22532 72 aa2.94□□□□□ -1.94
SRSF10-215ENST00000495785 M0QZ58 72 aa2.93□□□□□ -1.94
SRSF10-215ENST00000495785 PP632Q6XCG6 107 aa2.9□□□□□ -1.94
SRSF10-215ENST00000495785 C10orf95Q9H7T3 257 aa2.88□□□□□ -1.95
SRSF10-215ENST00000495785 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.88□□□□□ -1.95
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.8□□□□□ -1.96
SRSF10-215ENST00000495785 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.77□□□□□ -1.97
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa2.74□□□□□ -1.97
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.73□□□□□ -1.97
SRSF10-215ENST00000495785 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.72□□□□□ -1.97
SRSF10-215ENST00000495785 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
SRSF10-215ENST00000495785 MT1EP04732 61 aa2.7□□□□□ -1.98
SRSF10-215ENST00000495785 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa2.69□□□□□ -1.98
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.69□□□□□ -1.98
SRSF10-215ENST00000495785 A0A0D9SG42 100 aa2.64□□□□□ -1.99
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.63□□□□□ -1.99
SRSF10-215ENST00000495785 MT1GP13640 62 aa2.62□□□□□ -1.99
SRSF10-215ENST00000495785 MT4P47944 62 aa2.6□□□□□ -1.99
SRSF10-215ENST00000495785 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.6□□□□□ -1.99
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP12-1P59990 96 aa2.59□□□□□ -2
SRSF10-215ENST00000495785 MT1MQ8N339 61 aa2.58□□□□□ -2
SRSF10-215ENST00000495785 MT1LQ93083 61 aa2.57□□□□□ -2
SRSF10-215ENST00000495785 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.53□□□□□ -2
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.51□□□□□ -2.01
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.5□□□□□ -2.01
SRSF10-215ENST00000495785 TNP1P09430 55 aa2.44□□□□□ -2.02
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP12-3P60328 96 aa2.39□□□□□ -2.03
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.39□□□□□ -2.03
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP12-4P60329 112 aa2.33□□□□□ -2.04
SRSF10-215ENST00000495785 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.19□□□□□ -2.06
SRSF10-215ENST00000495785 MT1AP04731 61 aa2.16□□□□□ -2.06
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.11□□□□□ -2.07
SRSF10-215ENST00000495785 MUC5ACP98088 5654 aa2.11□□□□□ -2.07
SRSF10-215ENST00000495785 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
SRSF10-215ENST00000495785 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.06□□□□□ -2.08
SRSF10-215ENST00000495785 PRM1P04553 51 aa1.69□□□□□ -2.14
SRSF10-215ENST00000495785 PHGR1C9JFL3 82 aa1.46□□□□□ -2.18
SRSF10-215ENST00000495785 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.21□□□□□ -2.21
SRSF10-215ENST00000495785 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.11□□□□□ -2.23
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 222.5 ms