RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491240.5

RBM3-211, Transcript of RNA binding motif protein 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM3, Length 951 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa5.59□□□□□ -1.51
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.58□□□□□ -1.52
RBM3-211ENST00000491240 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.54□□□□□ -1.52
RBM3-211ENST00000491240 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.51□□□□□ -1.53
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP12-3P60328 96 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.48□□□□□ -1.53
RBM3-211ENST00000491240 PRR15LQ9BU68 103 aa5.47□□□□□ -1.53
RBM3-211ENST00000491240 CCDC179H3BU77 68 aa5.46□□□□□ -1.54
RBM3-211ENST00000491240 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.38□□□□□ -1.55
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.33□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa5.33□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 H3BS24 57 aa5.31□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5.3□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 UQCR11O14957 56 aa5.29□□□□□ -1.56
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.26□□□□□ -1.57
RBM3-211ENST00000491240 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.22□□□□□ -1.57
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP12-4P60329 112 aa5.22□□□□□ -1.57
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.21□□□□□ -1.58
RBM3-211ENST00000491240 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.19□□□□□ -1.58
RBM3-211ENST00000491240 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
RBM3-211ENST00000491240 TMEM258P61165 79 aa5.14□□□□□ -1.59
RBM3-211ENST00000491240 K7ERS5 55 aa5.09□□□□□ -1.59
RBM3-211ENST00000491240 PCP4P48539 62 aa5.06□□□□□ -1.6
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.05□□□□□ -1.6
RBM3-211ENST00000491240 PSPHP1O15172 72 aa5.04□□□□□ -1.6
RBM3-211ENST00000491240 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.02□□□□□ -1.61
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.99□□□□□ -1.61
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.94□□□□□ -1.62
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.93□□□□□ -1.62
RBM3-211ENST00000491240 MT1AP04731 61 aa4.91□□□□□ -1.62
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.9□□□□□ -1.63
RBM3-211ENST00000491240 V9GYY9 64 aa4.88□□□□□ -1.63
RBM3-211ENST00000491240 Q1T7F1 81 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.86□□□□□ -1.63
RBM3-211ENST00000491240 A6NED7 52 aa4.82□□□□□ -1.64
RBM3-211ENST00000491240 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.82□□□□□ -1.64
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.79□□□□□ -1.64
RBM3-211ENST00000491240 SVIPQ8NHG7 77 aa4.77□□□□□ -1.65
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.76□□□□□ -1.65
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-8O75690 187 aa4.74□□□□□ -1.65
RBM3-211ENST00000491240 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.74□□□□□ -1.65
RBM3-211ENST00000491240 ROMO1P60602 79 aa4.73□□□□□ -1.65
RBM3-211ENST00000491240 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.57□□□□□ -1.68
RBM3-211ENST00000491240 MUC5ACP98088 5654 aa4.54□□□□□ -1.68
RBM3-211ENST00000491240 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa4.53□□□□□ -1.68
RBM3-211ENST00000491240 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
RBM3-211ENST00000491240 MT3P25713 68 aa4.48□□□□□ -1.69
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.43□□□□□ -1.7
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.41□□□□□ -1.7
RBM3-211ENST00000491240 PRO0628Q9UI54 55 aa4.12□□□□□ -1.75
RBM3-211ENST00000491240 LCE1EQ5T753 118 aa4.1□□□□□ -1.75
RBM3-211ENST00000491240 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.02□□□□□ -1.77
RBM3-211ENST00000491240 BRK1Q8WUW1 75 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.97□□□□□ -1.77
RBM3-211ENST00000491240 A0A0A0MQY5 61 aa3.92□□□□□ -1.78
RBM3-211ENST00000491240 PMAIP1Q13794 54 aa3.88□□□□□ -1.79
RBM3-211ENST00000491240 LCE1CQ5T751 118 aa3.82□□□□□ -1.8
RBM3-211ENST00000491240 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.75□□□□□ -1.81
RBM3-211ENST00000491240 PRAC1Q96KF2 57 aa3.66□□□□□ -1.82
RBM3-211ENST00000491240 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.58□□□□□ -1.84
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.48□□□□□ -1.85
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RBM3-211ENST00000491240 LCE1FQ5T754 118 aa3.39□□□□□ -1.87
RBM3-211ENST00000491240 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.34□□□□□ -1.87
RBM3-211ENST00000491240 PHGR1C9JFL3 82 aa3.23□□□□□ -1.89
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.22□□□□□ -1.89
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.09□□□□□ -1.91
RBM3-211ENST00000491240 LUZP6Q538Z0 58 aa3.02□□□□□ -1.93
RBM3-211ENST00000491240 NDUFAF8A1L188 74 aa2.99□□□□□ -1.93
RBM3-211ENST00000491240 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.87□□□□□ -1.95
RBM3-211ENST00000491240 INE1O15225 51 aa2.52□□□□□ -2.01
RBM3-211ENST00000491240 PRM1P04553 51 aa2.46□□□□□ -2.02
RBM3-211ENST00000491240 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.4□□□□□ -2.03
RBM3-211ENST00000491240 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.01□□□□□ -2.09
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 143 ms