RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490914.1

SSB-211, Transcript of Sjogren syndrome antigen B, humanhuman

TSL 5

Gene SSB, Length 754 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSB-211ENST00000490914 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 IQGAP1P46940 1657 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-0.27□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-0.28□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 CENPEQ02224 2701 aa-0.28□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-0.28□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-0.28□□□□□ -2.45
SSB-211ENST00000490914 MROH2AA6NES4 1674 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 SPART-AS1P0CW21 52 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 TFF3Q07654 80 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 CDH23Q9H251 3354 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 CPS1P31327 1500 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 PRXQ9BXM0 1461 aa-0.29□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 CENPFP49454 3210 aa-0.3□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 DEFB131AP59861 70 aa-0.3□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 VPS13AQ96RL7 3174 aa-0.3□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 FANCD2Q9BXW9 1451 aa-0.3□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 DMDP11532 3685 aa-0.31□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 ADCY10Q96PN6 1610 aa-0.31□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 ABCC8Q09428 1581 aa-0.31□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 TRPM2O94759 1503 aa-0.31□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 BRCA2P51587 3418 aa-0.31□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 NDUFA1O15239 70 aa-0.32□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 PLNP26678 52 aa-0.32□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 CLTCL1P53675 1640 aa-0.32□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-0.32□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 SMIM2Q9BVW6 85 aa-0.33□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-0.33□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 ERICH3Q5RHP9 1530 aa-0.33□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 VCANP13611 3396 aa-0.34□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 CMC2Q9NRP2 79 aa-0.34□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-0.34□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 ATP7AQ04656 1500 aa-0.34□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 USP34Q70CQ2 3546 aa-0.34□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 XIRP2A4UGR9 3374 aa-0.34□□□□□ -2.46
SSB-211ENST00000490914 A0A096LNI7 61 aa-0.35□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.35□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 DEFB124Q8NES8 71 aa-0.35□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.35□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 IQGAP2Q13576 1575 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 ASPMQ8IZT6 3477 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 DEFB133Q30KQ1 61 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 TTTY10Q9BZA0 68 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 MROH2BQ7Z745 1585 aa-0.36□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 HTN1P15515 57 aa-0.37□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.37□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 UTRNP46939 3433 aa-0.38□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-0.38□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 LINC01556Q5JQF7 62 aa-0.39□□□□□ -2.47
SSB-211ENST00000490914 A0A096LPF7 62 aa-0.41□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 K7EIM0 57 aa-0.41□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 CD52P31358 61 aa-0.41□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 TOMM5Q8N4H5 51 aa-0.41□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 H3BUX3 64 aa-0.42□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 APELAP0DMC3 54 aa-0.42□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 GCC2Q8IWJ2 1684 aa-0.43□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 PRCDQ00LT1 54 aa-0.43□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa-0.44□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-0.44□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 H3BSH0 61 aa-0.45□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 HTN3P15516 51 aa-0.45□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-0.45□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 RPL39P5Q59GN2 51 aa-0.45□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 DEFB108AA8MXU0 73 aa-0.47□□□□□ -2.48
SSB-211ENST00000490914 DEFB108BQ8NET1 73 aa-0.5□□□□□ -2.49
SSB-211ENST00000490914 Q9Y3F1 56 aa-0.52□□□□□ -2.49
SSB-211ENST00000490914 COX14Q96I36 57 aa-0.53□□□□□ -2.49
SSB-211ENST00000490914 STATHP02808 62 aa-0.54□□□□□ -2.5
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