RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 PMAIP1Q13794 54 aa4.53□□□□□ -1.68
NISCH-211ENST00000488243 LCE3BQ5TA77 95 aa4.51□□□□□ -1.69
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa4.47□□□□□ -1.69
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.47□□□□□ -1.69
NISCH-211ENST00000488243 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.45□□□□□ -1.7
NISCH-211ENST00000488243 PP632Q6XCG6 107 aa4.45□□□□□ -1.7
NISCH-211ENST00000488243 LCE3AQ5TA76 89 aa4.43□□□□□ -1.7
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.35□□□□□ -1.71
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.34□□□□□ -1.71
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.33□□□□□ -1.72
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP12-3P60328 96 aa4.31□□□□□ -1.72
NISCH-211ENST00000488243 MT1EP04732 61 aa4.29□□□□□ -1.72
NISCH-211ENST00000488243 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.27□□□□□ -1.73
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.25□□□□□ -1.73
NISCH-211ENST00000488243 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.21□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.21□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.19□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 MT1GP13640 62 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.18□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 LCE1DQ5T752 114 aa4.17□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 MT1LQ93083 61 aa4.17□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 PRAC1Q96KF2 57 aa4.16□□□□□ -1.74
NISCH-211ENST00000488243 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.15□□□□□ -1.75
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.13□□□□□ -1.75
NISCH-211ENST00000488243 MT4P47944 62 aa4.07□□□□□ -1.76
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.06□□□□□ -1.76
NISCH-211ENST00000488243 MT1MQ8N339 61 aa4.05□□□□□ -1.76
NISCH-211ENST00000488243 LCE4AQ5TA78 99 aa4.02□□□□□ -1.77
NISCH-211ENST00000488243 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.01□□□□□ -1.77
NISCH-211ENST00000488243 SVIPQ8NHG7 77 aa3.99□□□□□ -1.77
NISCH-211ENST00000488243 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa3.95□□□□□ -1.78
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.92□□□□□ -1.78
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.91□□□□□ -1.78
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.9□□□□□ -1.79
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.87□□□□□ -1.79
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa3.85□□□□□ -1.79
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.7□□□□□ -1.82
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
NISCH-211ENST00000488243 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.68□□□□□ -1.82
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa3.68□□□□□ -1.82
NISCH-211ENST00000488243 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.61□□□□□ -1.83
NISCH-211ENST00000488243 MT1AP04731 61 aa3.58□□□□□ -1.84
NISCH-211ENST00000488243 LUZP6Q538Z0 58 aa3.58□□□□□ -1.84
NISCH-211ENST00000488243 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
NISCH-211ENST00000488243 MUC5ACP98088 5654 aa3.54□□□□□ -1.84
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP12-4P60329 112 aa3.54□□□□□ -1.84
NISCH-211ENST00000488243 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa3.48□□□□□ -1.85
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa3.48□□□□□ -1.85
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.42□□□□□ -1.86
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-8O75690 187 aa3.41□□□□□ -1.86
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.3□□□□□ -1.88
NISCH-211ENST00000488243 MT3P25713 68 aa3.29□□□□□ -1.88
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.28□□□□□ -1.88
NISCH-211ENST00000488243 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.26□□□□□ -1.89
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa3.26□□□□□ -1.89
NISCH-211ENST00000488243 NDUFAF8A1L188 74 aa3.21□□□□□ -1.9
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.05□□□□□ -1.92
NISCH-211ENST00000488243 LCE3DQ9BYE3 92 aa2.99□□□□□ -1.93
NISCH-211ENST00000488243 LCE1EQ5T753 118 aa2.95□□□□□ -1.94
NISCH-211ENST00000488243 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.88□□□□□ -1.95
NISCH-211ENST00000488243 A0A0A0MQY5 61 aa2.86□□□□□ -1.95
NISCH-211ENST00000488243 INE1O15225 51 aa2.76□□□□□ -1.97
NISCH-211ENST00000488243 LCE1CQ5T751 118 aa2.72□□□□□ -1.97
NISCH-211ENST00000488243 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.72□□□□□ -1.97
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.67□□□□□ -1.98
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.59□□□□□ -1.99
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
NISCH-211ENST00000488243 PHGR1C9JFL3 82 aa2.44□□□□□ -2.02
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.44□□□□□ -2.02
NISCH-211ENST00000488243 LCE1FQ5T754 118 aa2.39□□□□□ -2.03
NISCH-211ENST00000488243 H3BS24 57 aa2.36□□□□□ -2.03
NISCH-211ENST00000488243 PRM1P04553 51 aa2.34□□□□□ -2.03
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.3□□□□□ -2.04
NISCH-211ENST00000488243 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.08□□□□□ -2.08
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.03□□□□□ -2.08
NISCH-211ENST00000488243 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.85□□□□□ -2.11
NISCH-211ENST00000488243 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.47□□□□□ -2.17
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