RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484101.5

UFD1-208, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, human

TSL 5

Gene UFD1, Length 751 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		3.85	□□□□□ -1.79
UFD1-208	ENST00000484101	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		3.82	□□□□□ -1.8
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	3.75	□□□□□ -1.81
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.71	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	LUZP6	Q538Z0	58 aa		3.71	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.69	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	NDUFAF8	A1L188	74 aa		3.68	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	SPRR2E	P22531	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	SPRR2B	P35325	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	SPRR2A	P35326	72 aa		3.67	□□□□□ -1.82
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		3.64	□□□□□ -1.83
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.58	□□□□□ -1.84
UFD1-208	ENST00000484101	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		3.57	□□□□□ -1.84
UFD1-208	ENST00000484101	SPRR2D	P22532	72 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UFD1-208	ENST00000484101	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		3.56	□□□□□ -1.84
UFD1-208	ENST00000484101	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.55	□□□□□ -1.84
UFD1-208	ENST00000484101	LCE3B	Q5TA77	95 aa		3.52	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.51	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		3.5	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		3.49	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.48	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		3.47	□□□□□ -1.85
UFD1-208	ENST00000484101	MT1E	P04732	61 aa		3.45	□□□□□ -1.86
UFD1-208	ENST00000484101	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.43	□□□□□ -1.86
UFD1-208	ENST00000484101	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	3.42	□□□□□ -1.86
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.41	□□□□□ -1.86
UFD1-208	ENST00000484101	MT1L	Q93083	61 aa		3.41	□□□□□ -1.86
UFD1-208	ENST00000484101	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.4	□□□□□ -1.87
UFD1-208	ENST00000484101	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.36	□□□□□ -1.87
UFD1-208	ENST00000484101	MT3	P25713	68 aa		3.32	□□□□□ -1.88
UFD1-208	ENST00000484101	MT1G	P13640	62 aa		3.31	□□□□□ -1.88
UFD1-208	ENST00000484101	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.31	□□□□□ -1.88
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.31	□□□□□ -1.88
UFD1-208	ENST00000484101	MT1M	Q8N339	61 aa		3.24	□□□□□ -1.89
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.2	□□□□□ -1.9
UFD1-208	ENST00000484101	MT4	P47944	62 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.17	□□□□□ -1.9
UFD1-208	ENST00000484101	INE1	O15225	51 aa		3.13	□□□□□ -1.91
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.06	□□□□□ -1.92
UFD1-208	ENST00000484101	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.95	□□□□□ -1.94
UFD1-208	ENST00000484101	MT1A	P04731	61 aa		2.93	□□□□□ -1.94
UFD1-208	ENST00000484101	MUC5AC	P98088	5654 aa		2.93	□□□□□ -1.94
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	2.92	□□□□□ -1.94
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		2.9	□□□□□ -1.95
UFD1-208	ENST00000484101	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	2.9	□□□□□ -1.95
UFD1-208	ENST00000484101	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.88	□□□□□ -1.95
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.83	□□□□□ -1.96
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		2.82	□□□□□ -1.96
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-8	O75690	187 aa		2.73	□□□□□ -1.97
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP12-4	P60329	112 aa		2.72	□□□□□ -1.97
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.68	□□□□□ -1.98
UFD1-208	ENST00000484101	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.65	□□□□□ -1.99
UFD1-208	ENST00000484101	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	2.62	□□□□□ -1.99
UFD1-208	ENST00000484101	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.6	□□□□□ -1.99
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.59	□□□□□ -1.99
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		2.56	□□□□□ -2
UFD1-208	ENST00000484101	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.39	□□□□□ -2.03
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.34	□□□□□ -2.03
UFD1-208	ENST00000484101	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.31	□□□□□ -2.04
UFD1-208	ENST00000484101	PRM1	P04553	51 aa		2.3	□□□□□ -2.04
UFD1-208	ENST00000484101	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.13	□□□□□ -2.07
UFD1-208	ENST00000484101	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.13	□□□□□ -2.07
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.03	□□□□□ -2.08
UFD1-208	ENST00000484101	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.01	□□□□□ -2.09
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		1.92	□□□□□ -2.1
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		1.86	□□□□□ -2.11
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.55	□□□□□ -2.16
UFD1-208	ENST00000484101	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.52	□□□□□ -2.17
UFD1-208	ENST00000484101	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.51	□□□□□ -2.17
UFD1-208	ENST00000484101	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.07	□□□□□ -2.24

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