RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466245.1

TTLL3-223, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 3

Gene TTLL3, Length 616 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE1D	Q5T752	114 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TTLL3-223	ENST00000466245	PMAIP1	Q13794	54 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245		K7ERS5	55 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	MT1E	P04732	61 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	TNP1	P09430	55 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE4A	Q5TA78	99 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	HMCN1	Q96RW7	5635 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	MT4	P47944	62 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TTLL3-223	ENST00000466245	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TTLL3-223	ENST00000466245	AHNAK2	Q8IVF2	5795 aa		3.69	□□□□□ -1.82
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-10	Q6L8G5	202 aa		3.67	□□□□□ -1.82
TTLL3-223	ENST00000466245	PP632	Q6XCG6	107 aa		3.66	□□□□□ -1.82
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		3.65	□□□□□ -1.83
TTLL3-223	ENST00000466245	MT1G	P13640	62 aa		3.64	□□□□□ -1.83
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE3A	Q5TA76	89 aa		3.63	□□□□□ -1.83
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-7	Q6L8G8	165 aa		3.61	□□□□□ -1.83
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		3.59	□□□□□ -1.83
TTLL3-223	ENST00000466245	MT1L	Q93083	61 aa		3.58	□□□□□ -1.84
TTLL3-223	ENST00000466245	ROMO1	P60602	79 aa		3.57	□□□□□ -1.84
TTLL3-223	ENST00000466245	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL3-223	ENST00000466245	MT1M	Q8N339	61 aa		3.54	□□□□□ -1.84
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP23-1	A1A580	65 aa		3.53	□□□□□ -1.84
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		3.52	□□□□□ -1.85
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-6	Q9BYQ5	205 aa		3.51	□□□□□ -1.85
TTLL3-223	ENST00000466245	PRAC1	Q96KF2	57 aa		3.5	□□□□□ -1.85
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.49	□□□□□ -1.85
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-3	Q9BYR4	195 aa		3.39	□□□□□ -1.87
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP20-2	Q3LI61	65 aa		3.38	□□□□□ -1.87
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP12-4	P60329	112 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		3.34	□□□□□ -1.87
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.33	□□□□□ -1.88
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-5	Q701N2	237 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE3C	Q5T5A8	94 aa		3.26	□□□□□ -1.89
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TTLL3-223	ENST00000466245	AHNAK	Q09666	5890 aa	Known RBP	3.16	□□□□□ -1.9
TTLL3-223	ENST00000466245	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		3.16	□□□□□ -1.9
TTLL3-223	ENST00000466245	SYNE1	Q8NF91	8797 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC5AC	P98088	5654 aa		3.11	□□□□□ -1.91
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC5B	Q9HC84	5762 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245		H3BS24	57 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-8	O75690	187 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245	MT1A	P04731	61 aa		3.07	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP9-6	A8MVA2	160 aa		3.05	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		3.04	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-2	Q701N4	177 aa		3.03	□□□□□ -1.92
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP6-1	Q3LI64	71 aa		2.99	□□□□□ -1.93
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		2.94	□□□□□ -1.94
TTLL3-223	ENST00000466245	OBSCN	Q5VST9	7968 aa		2.92	□□□□□ -1.94
TTLL3-223	ENST00000466245	NDUFAF8	A1L188	74 aa		2.91	□□□□□ -1.94
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP6-2	Q3LI66	62 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TTLL3-223	ENST00000466245	LUZP6	Q538Z0	58 aa		2.86	□□□□□ -1.95
TTLL3-223	ENST00000466245	MT3	P25713	68 aa		2.8	□□□□□ -1.96
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
TTLL3-223	ENST00000466245		A0A0A0MQY5	61 aa		2.7	□□□□□ -1.98
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE1E	Q5T753	118 aa		2.61	□□□□□ -1.99
TTLL3-223	ENST00000466245	INE1	O15225	51 aa		2.48	□□□□□ -2.01
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE1B	Q5T7P3	118 aa		2.47	□□□□□ -2.01
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		2.42	□□□□□ -2.02
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE1C	Q5T751	118 aa		2.4	□□□□□ -2.03
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE3D	Q9BYE3	92 aa		2.36	□□□□□ -2.03
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-12	Q9BQ66	201 aa		2.33	□□□□□ -2.04
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE3E	Q5T5B0	92 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TTLL3-223	ENST00000466245	LCE1F	Q5T754	118 aa		2.25	□□□□□ -2.05
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-6	Q6L8G9	129 aa	Predicted RBP	2.23	□□□□□ -2.05
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP5-11	Q6L8G4	156 aa		2.22	□□□□□ -2.05
TTLL3-223	ENST00000466245	PHGR1	C9JFL3	82 aa		2.2	□□□□□ -2.06
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP21-2	Q3LI59	83 aa		2.01	□□□□□ -2.09
TTLL3-223	ENST00000466245	PRM1	P04553	51 aa		1.88	□□□□□ -2.11
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC19	Q7Z5P9	8384 aa		1.81	□□□□□ -2.12
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		1.8	□□□□□ -2.12
TTLL3-223	ENST00000466245	KRTAP21-1	Q3LI58	79 aa		1.7	□□□□□ -2.14
TTLL3-223	ENST00000466245	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		1.25	□□□□□ -2.21

Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 127.8 ms