RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461691.6

ZBED1-204, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene ZBED1, Length 947 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-204ENST00000461691 MT1LQ93083 61 aa4.96□□□□□ -1.62
ZBED1-204ENST00000461691 LCE4AQ5TA78 99 aa4.94□□□□□ -1.62
ZBED1-204ENST00000461691 TNP1P09430 55 aa4.92□□□□□ -1.62
ZBED1-204ENST00000461691 LCE3AQ5TA76 89 aa4.92□□□□□ -1.62
ZBED1-204ENST00000461691 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.92□□□□□ -1.62
ZBED1-204ENST00000461691 MT4P47944 62 aa4.9□□□□□ -1.63
ZBED1-204ENST00000461691 PRR15LQ9BU68 103 aa4.86□□□□□ -1.63
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.86□□□□□ -1.63
ZBED1-204ENST00000461691 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa4.84□□□□□ -1.63
ZBED1-204ENST00000461691 PMAIP1Q13794 54 aa4.81□□□□□ -1.64
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.81□□□□□ -1.64
ZBED1-204ENST00000461691 HMCN1Q96RW7 5635 aa4.8□□□□□ -1.64
ZBED1-204ENST00000461691 BRK1Q8WUW1 75 aa4.79□□□□□ -1.64
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP12-3P60328 96 aa4.74□□□□□ -1.65
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa4.74□□□□□ -1.65
ZBED1-204ENST00000461691 Q1T7F1 81 aa4.72□□□□□ -1.65
ZBED1-204ENST00000461691 UQCR11O14957 56 aa4.71□□□□□ -1.66
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.71□□□□□ -1.66
ZBED1-204ENST00000461691 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa4.69□□□□□ -1.66
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.66□□□□□ -1.66
ZBED1-204ENST00000461691 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.64□□□□□ -1.67
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ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.58□□□□□ -1.68
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa4.56□□□□□ -1.68
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.54□□□□□ -1.68
ZBED1-204ENST00000461691 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.53□□□□□ -1.68
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.51□□□□□ -1.69
ZBED1-204ENST00000461691 K7ERS5 55 aa4.5□□□□□ -1.69
ZBED1-204ENST00000461691 PSPHP1O15172 72 aa4.5□□□□□ -1.69
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP12-4P60329 112 aa4.5□□□□□ -1.69
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.47□□□□□ -1.69
ZBED1-204ENST00000461691 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa4.47□□□□□ -1.69
ZBED1-204ENST00000461691 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.46□□□□□ -1.7
ZBED1-204ENST00000461691 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.39□□□□□ -1.71
ZBED1-204ENST00000461691 A6NED7 52 aa4.39□□□□□ -1.71
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.39□□□□□ -1.71
ZBED1-204ENST00000461691 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.34□□□□□ -1.71
ZBED1-204ENST00000461691 H3BS24 57 aa4.32□□□□□ -1.72
ZBED1-204ENST00000461691 MT1AP04731 61 aa4.23□□□□□ -1.73
ZBED1-204ENST00000461691 ROMO1P60602 79 aa4.21□□□□□ -1.74
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.21□□□□□ -1.74
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.19□□□□□ -1.74
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.19□□□□□ -1.74
ZBED1-204ENST00000461691 PRAC1Q96KF2 57 aa4.1□□□□□ -1.75
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa4.1□□□□□ -1.75
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.09□□□□□ -1.75
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-8O75690 187 aa4.05□□□□□ -1.76
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.04□□□□□ -1.76
ZBED1-204ENST00000461691 OBSCNQ5VST9 7968 aa3.9□□□□□ -1.78
ZBED1-204ENST00000461691 MUC5ACP98088 5654 aa3.88□□□□□ -1.79
ZBED1-204ENST00000461691 MT3P25713 68 aa3.88□□□□□ -1.79
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.88□□□□□ -1.79
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ZBED1-204ENST00000461691 NDUFAF8A1L188 74 aa3.66□□□□□ -1.82
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ZBED1-204ENST00000461691 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.4□□□□□ -1.87
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa3.39□□□□□ -1.87
ZBED1-204ENST00000461691 LCE1CQ5T751 118 aa3.33□□□□□ -1.88
ZBED1-204ENST00000461691 INE1O15225 51 aa3.21□□□□□ -1.9
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.13□□□□□ -1.91
ZBED1-204ENST00000461691 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.11□□□□□ -1.91
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.03□□□□□ -1.92
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
ZBED1-204ENST00000461691 LCE1FQ5T754 118 aa2.98□□□□□ -1.93
ZBED1-204ENST00000461691 LCE3EQ5T5B0 92 aa2.91□□□□□ -1.94
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.76□□□□□ -1.97
ZBED1-204ENST00000461691 PHGR1C9JFL3 82 aa2.73□□□□□ -1.97
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.56□□□□□ -2
ZBED1-204ENST00000461691 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.43□□□□□ -2.02
ZBED1-204ENST00000461691 PRM1P04553 51 aa2.14□□□□□ -2.07
ZBED1-204ENST00000461691 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.08□□□□□ -2.08
ZBED1-204ENST00000461691 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.8□□□□□ -2.12
Retrieved 78 of 20,778 RNA–protein pairs in 133.9 ms