RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000446688.5

TNS1-209, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 4,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP12-4P60329 112 aa3.36□□□□□ -1.87
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.31□□□□□ -1.88
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.3□□□□□ -1.88
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.3□□□□□ -1.88
TNS1-209ENST00000446688 MT1LQ93083 61 aa3.26□□□□□ -1.89
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.26□□□□□ -1.89
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.26□□□□□ -1.89
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.26□□□□□ -1.89
TNS1-209ENST00000446688 MT1EP04732 61 aa3.25□□□□□ -1.89
TNS1-209ENST00000446688 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.22□□□□□ -1.89
TNS1-209ENST00000446688 USH2AO75445 5202 aa3.19□□□□□ -1.9
TNS1-209ENST00000446688 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.18□□□□□ -1.9
TNS1-209ENST00000446688 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.15□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 MT1MQ8N339 61 aa3.15□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.13□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.12□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.1□□□□□ -1.91
TNS1-209ENST00000446688 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.07□□□□□ -1.92
TNS1-209ENST00000446688 KMT2DO14686 5537 aa3.06□□□□□ -1.92
TNS1-209ENST00000446688 MT4P47944 62 aa3.05□□□□□ -1.92
TNS1-209ENST00000446688 MT3P25713 68 aa3.03□□□□□ -1.92
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.99□□□□□ -1.93
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.96□□□□□ -1.94
TNS1-209ENST00000446688 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
TNS1-209ENST00000446688 PRM1P04553 51 aa2.96□□□□□ -1.94
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
TNS1-209ENST00000446688 LCE1DQ5T752 114 aa2.9□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.9□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.9□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 MT1AP04731 61 aa2.9□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 SSPOA2VEC9 5147 aa2.89□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 MUC12Q9UKN1 5478 aa2.86□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa2.85□□□□□ -1.95
TNS1-209ENST00000446688 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.79□□□□□ -1.96
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.77□□□□□ -1.97
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.75□□□□□ -1.97
TNS1-209ENST00000446688 MDN1Q9NU22 5596 aa2.74□□□□□ -1.97
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-9P26371 169 aa2.73□□□□□ -1.97
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.71□□□□□ -1.98
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.68□□□□□ -1.98
TNS1-209ENST00000446688 MUC19Q7Z5P9 8384 aa2.66□□□□□ -1.98
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.65□□□□□ -1.99
TNS1-209ENST00000446688 LCE4AQ5TA78 99 aa2.63□□□□□ -1.99
TNS1-209ENST00000446688 NEBP20929 6669 aa2.6□□□□□ -1.99
TNS1-209ENST00000446688 GPR98Q8WXG9 6306 aa2.54□□□□□ -2
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
TNS1-209ENST00000446688 LCE1EQ5T753 118 aa2.44□□□□□ -2.02
TNS1-209ENST00000446688 LCE1CQ5T751 118 aa2.42□□□□□ -2.02
TNS1-209ENST00000446688 LCE1FQ5T754 118 aa2.42□□□□□ -2.02
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.38□□□□□ -2.03
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.3□□□□□ -2.04
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.28□□□□□ -2.04
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa2.22□□□□□ -2.05
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.17□□□□□ -2.06
TNS1-209ENST00000446688 MUC5ACP98088 5654 aa2.16□□□□□ -2.06
TNS1-209ENST00000446688 HMCN1Q96RW7 5635 aa2.13□□□□□ -2.07
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.05□□□□□ -2.08
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.05□□□□□ -2.08
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.05□□□□□ -2.08
TNS1-209ENST00000446688 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa2.02□□□□□ -2.09
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2□□□□□ -2.09
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.94□□□□□ -2.1
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.85□□□□□ -2.11
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-8O75690 187 aa1.82□□□□□ -2.12
TNS1-209ENST00000446688 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.69□□□□□ -2.14
TNS1-209ENST00000446688 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.69□□□□□ -2.14
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.69□□□□□ -2.14
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.62□□□□□ -2.15
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.6□□□□□ -2.15
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.59□□□□□ -2.16
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.56□□□□□ -2.16
TNS1-209ENST00000446688 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
TNS1-209ENST00000446688 PHGR1C9JFL3 82 aa1.5□□□□□ -2.17
TNS1-209ENST00000446688 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.95□□□□□ -2.26
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.6 ms