RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000427110.6

PTPRC-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 264 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-208ENST00000427110 KIAA1109Q2LD37 5005 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRC-208ENST00000427110 LINC01554Q52M75 96 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRC-208ENST00000427110 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
PTPRC-208ENST00000427110 HERC1Q15751 4861 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRC-208ENST00000427110 S4R3F8 94 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 BIRC6Q9NR09 4857 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 HERC2O95714 4834 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP0.64□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 M0QZ58 72 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 CSAG1Q6PB30 78 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 ABCA13Q86UQ4 5058 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 ROMO1P60602 79 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 HMCN2Q8NDA2 5059 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 A0A0D9SG42 100 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 CRIPTQ9P021 101 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRC-208ENST00000427110 PCLOQ9Y6V0 5065 aa0.59□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 INE1O15225 51 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 SPRR2GQ9BYE4 73 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 FAT4Q6V0I7 4981 aa0.57□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 TNP1P09430 55 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MT1HP80294 61 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 PLAC4Q8WY50 150 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MUC2Q02817 5179 aa0.56□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 UBR4Q5T4S7 5183 aa0.55□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MT2AP02795 61 aa0.55□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 RNF213Q63HN8 5207 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MT1FP04733 61 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MT1BP07438 61 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.54□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 M0R2T5 61 aa0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MT1XP80297 61 aa0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.53□□□□□ -2.32
PTPRC-208ENST00000427110 SSPOA2VEC9 5147 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-208ENST00000427110 HMCN1Q96RW7 5635 aa0.48□□□□□ -2.33
PTPRC-208ENST00000427110 USH2AO75445 5202 aa0.47□□□□□ -2.33
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa0.47□□□□□ -2.33
PTPRC-208ENST00000427110 MT1EP04732 61 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 MT1LQ93083 61 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.46□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP0.45□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 MT1GP13640 62 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 KMT2DO14686 5537 aa0.45□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 MT1MQ8N339 61 aa0.43□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP0.41□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 FSIP2Q5CZC0 6907 aa0.4□□□□□ -2.34
PTPRC-208ENST00000427110 MUC12Q9UKN1 5478 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 MT1AP04731 61 aa0.4□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.39□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.38□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 SPRR2EP22531 72 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 SPRR2BP35325 72 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 SPRR2AP35326 72 aa0.36□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 MDN1Q9NU22 5596 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 SPRR2DP22532 72 aa0.35□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 NEBP20929 6669 aa0.34□□□□□ -2.35
PTPRC-208ENST00000427110 PRM1P04553 51 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 MT4P47944 62 aa0.29□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 MUC5ACP98088 5654 aa0.28□□□□□ -2.36
PTPRC-208ENST00000427110 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP0.25□□□□□ -2.37
PTPRC-208ENST00000427110 PHGR1C9JFL3 82 aa0.24□□□□□ -2.37
PTPRC-208ENST00000427110 GPR98Q8WXG9 6306 aa0.2□□□□□ -2.38
PTPRC-208ENST00000427110 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.17□□□□□ -2.38
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