RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000381222.8

ZBED1-202, Transcript of zinc finger BED-type containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED1, Length 4,507 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1-202ENST00000381222 SPRR2BP35325 72 aa5.03□□□□□ -1.6
ZBED1-202ENST00000381222 SPRR2AP35326 72 aa5.03□□□□□ -1.6
ZBED1-202ENST00000381222 MT1EP04732 61 aa5.02□□□□□ -1.61
ZBED1-202ENST00000381222 MT1LQ93083 61 aa5.02□□□□□ -1.61
ZBED1-202ENST00000381222 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.02□□□□□ -1.61
ZBED1-202ENST00000381222 LCE3BQ5TA77 95 aa5□□□□□ -1.61
ZBED1-202ENST00000381222 LOC100996750A0A140TA64 210 aa5□□□□□ -1.61
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.96□□□□□ -1.62
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa4.36□□□□□ -1.71
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.34□□□□□ -1.71
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.97□□□□□ -1.77
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ZBED1-202ENST00000381222 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.85□□□□□ -1.79
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.78□□□□□ -1.8
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ZBED1-202ENST00000381222 MUC5ACP98088 5654 aa3.56□□□□□ -1.84
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa2.96□□□□□ -1.94
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-2Q701N4 177 aa2.87□□□□□ -1.95
ZBED1-202ENST00000381222 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.87□□□□□ -1.95
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-8O75690 187 aa2.8□□□□□ -1.96
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ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa2.63□□□□□ -1.99
ZBED1-202ENST00000381222 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.56□□□□□ -2
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa2.45□□□□□ -2.02
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa2.3□□□□□ -2.04
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.16□□□□□ -2.06
ZBED1-202ENST00000381222 PHGR1C9JFL3 82 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.03□□□□□ -2.08
ZBED1-202ENST00000381222 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.9□□□□□ -2.11
ZBED1-202ENST00000381222 MUC16Q8WXI7 14507 aa1.4□□□□□ -2.19
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