RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 MT4P47944 62 aa7.22□□□□□ -1.25
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.18□□□□□ -1.26
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE1BQ5T7P3 118 aa7.09□□□□□ -1.27
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE1DQ5T752 114 aa7.04□□□□□ -1.28
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.01□□□□□ -1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 MT1AP04731 61 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.97□□□□□ -1.29
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa6.94□□□□□ -1.3
GNPTAB-201ENST00000299314 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.78□□□□□ -1.32
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GNPTAB-201ENST00000299314 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.61□□□□□ -1.35
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.59□□□□□ -1.35
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF213Q63HN8 5207 aa6.56□□□□□ -1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 FAT4Q6V0I7 4981 aa6.56□□□□□ -1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.56□□□□□ -1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.55□□□□□ -1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.55□□□□□ -1.36
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.44□□□□□ -1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.43□□□□□ -1.38
GNPTAB-201ENST00000299314 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.34□□□□□ -1.39
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.31□□□□□ -1.4
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.3□□□□□ -1.4
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.27□□□□□ -1.41
GNPTAB-201ENST00000299314 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.27□□□□□ -1.41
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC2Q02817 5179 aa6.23□□□□□ -1.41
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.16□□□□□ -1.42
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE4AQ5TA78 99 aa6.13□□□□□ -1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.12□□□□□ -1.43
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE1CQ5T751 118 aa6.01□□□□□ -1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE1EQ5T753 118 aa6.01□□□□□ -1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 LCE1FQ5T754 118 aa6.01□□□□□ -1.45
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.87□□□□□ -1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
GNPTAB-201ENST00000299314 USH2AO75445 5202 aa5.56□□□□□ -1.52
GNPTAB-201ENST00000299314 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.51□□□□□ -1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.49□□□□□ -1.53
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.37□□□□□ -1.55
GNPTAB-201ENST00000299314 KMT2DO14686 5537 aa5.31□□□□□ -1.56
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa5.21□□□□□ -1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-9P26371 169 aa5.19□□□□□ -1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.14□□□□□ -1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SSPOA2VEC9 5147 aa5.13□□□□□ -1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NEBP20929 6669 aa5.06□□□□□ -1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.03□□□□□ -1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.97□□□□□ -1.61
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.79□□□□□ -1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.79□□□□□ -1.64
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC19Q7Z5P9 8384 aa4.75□□□□□ -1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa4.72□□□□□ -1.65
GNPTAB-201ENST00000299314 MDN1Q9NU22 5596 aa4.51□□□□□ -1.69
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4.1□□□□□ -1.75
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.05□□□□□ -1.76
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC5ACP98088 5654 aa4.01□□□□□ -1.77
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa3.89□□□□□ -1.79
GNPTAB-201ENST00000299314 HMCN1Q96RW7 5635 aa3.73□□□□□ -1.81
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-8O75690 187 aa3.71□□□□□ -1.82
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-2Q701N4 177 aa3.59□□□□□ -1.83
GNPTAB-201ENST00000299314 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa3.55□□□□□ -1.84
GNPTAB-201ENST00000299314 PHGR1C9JFL3 82 aa3.45□□□□□ -1.86
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.43□□□□□ -1.86
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa3.33□□□□□ -1.88
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.23□□□□□ -1.89
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.14□□□□□ -1.91
GNPTAB-201ENST00000299314 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP2.89□□□□□ -1.95
GNPTAB-201ENST00000299314 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.57□□□□□ -2
GNPTAB-201ENST00000299314 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.03□□□□□ -2.09
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