RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233336.6

TTL-201, Transcript of tubulin tyrosine ligase, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTL, Length 14,269 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTL-201ENST00000233336 RYR2Q92736 4967 aa2.91□□□□□ -1.94
TTL-201ENST00000233336 MT4P47944 62 aa2.91□□□□□ -1.94
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa2.91□□□□□ -1.94
TTL-201ENST00000233336 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa2.9□□□□□ -1.95
TTL-201ENST00000233336 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.88□□□□□ -1.95
TTL-201ENST00000233336 LCE1DQ5T752 114 aa2.87□□□□□ -1.95
TTL-201ENST00000233336 MT1AP04731 61 aa2.87□□□□□ -1.95
TTL-201ENST00000233336 PCLOQ9Y6V0 5065 aa2.87□□□□□ -1.95
TTL-201ENST00000233336 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa2.82□□□□□ -1.96
TTL-201ENST00000233336 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP2.81□□□□□ -1.96
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa2.77□□□□□ -1.97
TTL-201ENST00000233336 HERC2O95714 4834 aa2.76□□□□□ -1.97
TTL-201ENST00000233336 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa2.75□□□□□ -1.97
TTL-201ENST00000233336 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.74□□□□□ -1.97
TTL-201ENST00000233336 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.73□□□□□ -1.97
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.72□□□□□ -1.97
TTL-201ENST00000233336 HERC1Q15751 4861 aa2.69□□□□□ -1.98
TTL-201ENST00000233336 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP2.67□□□□□ -1.98
TTL-201ENST00000233336 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
TTL-201ENST00000233336 LCE5AQ5TCM9 118 aa2.65□□□□□ -1.98
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa2.63□□□□□ -1.99
TTL-201ENST00000233336 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa2.6□□□□□ -1.99
TTL-201ENST00000233336 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.54□□□□□ -2
TTL-201ENST00000233336 MUC2Q02817 5179 aa2.52□□□□□ -2.01
TTL-201ENST00000233336 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.5□□□□□ -2.01
TTL-201ENST00000233336 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
TTL-201ENST00000233336 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.46□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 LCE1CQ5T751 118 aa2.44□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 LCE1EQ5T753 118 aa2.44□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 LCE1FQ5T754 118 aa2.44□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 RNF213Q63HN8 5207 aa2.44□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 ABCA13Q86UQ4 5058 aa2.44□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa2.42□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 LCE4AQ5TA78 99 aa2.41□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa2.41□□□□□ -2.02
TTL-201ENST00000233336 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.39□□□□□ -2.03
TTL-201ENST00000233336 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa2.39□□□□□ -2.03
TTL-201ENST00000233336 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa2.38□□□□□ -2.03
TTL-201ENST00000233336 KMT2DO14686 5537 aa2.38□□□□□ -2.03
TTL-201ENST00000233336 OBSCNQ5VST9 7968 aa2.3□□□□□ -2.04
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
TTL-201ENST00000233336 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP2.26□□□□□ -2.05
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP2.23□□□□□ -2.05
TTL-201ENST00000233336 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP2.18□□□□□ -2.06
TTL-201ENST00000233336 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa2.15□□□□□ -2.07
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-9P26371 169 aa2.11□□□□□ -2.07
TTL-201ENST00000233336 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.1□□□□□ -2.07
TTL-201ENST00000233336 USH2AO75445 5202 aa2.09□□□□□ -2.08
TTL-201ENST00000233336 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.07□□□□□ -2.08
TTL-201ENST00000233336 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa2.07□□□□□ -2.08
TTL-201ENST00000233336 SSPOA2VEC9 5147 aa1.98□□□□□ -2.09
TTL-201ENST00000233336 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.96□□□□□ -2.1
TTL-201ENST00000233336 MUC12Q9UKN1 5478 aa1.94□□□□□ -2.1
TTL-201ENST00000233336 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa1.94□□□□□ -2.1
TTL-201ENST00000233336 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa1.94□□□□□ -2.1
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa1.91□□□□□ -2.1
TTL-201ENST00000233336 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP1.89□□□□□ -2.11
TTL-201ENST00000233336 NEBP20929 6669 aa1.85□□□□□ -2.11
TTL-201ENST00000233336 MDN1Q9NU22 5596 aa1.79□□□□□ -2.12
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa1.7□□□□□ -2.14
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa1.64□□□□□ -2.15
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-2Q701N4 177 aa1.56□□□□□ -2.16
TTL-201ENST00000233336 MUC5ACP98088 5654 aa1.51□□□□□ -2.17
TTL-201ENST00000233336 GPR98Q8WXG9 6306 aa1.48□□□□□ -2.17
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-8O75690 187 aa1.47□□□□□ -2.17
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa1.46□□□□□ -2.18
TTL-201ENST00000233336 HMCN1Q96RW7 5635 aa1.43□□□□□ -2.18
TTL-201ENST00000233336 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa1.41□□□□□ -2.18
TTL-201ENST00000233336 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP1.39□□□□□ -2.19
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa1.39□□□□□ -2.19
TTL-201ENST00000233336 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa1.39□□□□□ -2.19
TTL-201ENST00000233336 PHGR1C9JFL3 82 aa1.3□□□□□ -2.2
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP1.25□□□□□ -2.21
TTL-201ENST00000233336 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa1.21□□□□□ -2.22
TTL-201ENST00000233336 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
TTL-201ENST00000233336 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa1.1□□□□□ -2.23
TTL-201ENST00000233336 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.86□□□□□ -2.27
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 86.9 ms