RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233025.11

SPCS1-201, Transcript of signal peptidase complex subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPCS1, Length 1,082 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS1-201ENST00000233025 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.72□□□□□ -1.33
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.69□□□□□ -1.34
SPCS1-201ENST00000233025 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.69□□□□□ -1.34
SPCS1-201ENST00000233025 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.68□□□□□ -1.34
SPCS1-201ENST00000233025 P0C880 135 aa6.59□□□□□ -1.35
SPCS1-201ENST00000233025 A8MU10 97 aa6.57□□□□□ -1.36
SPCS1-201ENST00000233025 M0QZ58 72 aa6.54□□□□□ -1.36
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.53□□□□□ -1.36
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP10-12P60413 245 aa6.52□□□□□ -1.37
SPCS1-201ENST00000233025 PLAC4Q8WY50 150 aa6.52□□□□□ -1.37
SPCS1-201ENST00000233025 K7ERS5 55 aa6.51□□□□□ -1.37
SPCS1-201ENST00000233025 PMAIP1Q13794 54 aa6.48□□□□□ -1.37
SPCS1-201ENST00000233025 R4GN34 69 aa6.48□□□□□ -1.37
SPCS1-201ENST00000233025 MT4P47944 62 aa6.46□□□□□ -1.38
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.45□□□□□ -1.38
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0D9SG42 100 aa6.44□□□□□ -1.38
SPCS1-201ENST00000233025 LINC01554Q52M75 96 aa6.35□□□□□ -1.39
SPCS1-201ENST00000233025 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.32□□□□□ -1.4
SPCS1-201ENST00000233025 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.28□□□□□ -1.4
SPCS1-201ENST00000233025 SVIPQ8NHG7 77 aa6.28□□□□□ -1.4
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.27□□□□□ -1.41
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP12-1P59990 96 aa6.26□□□□□ -1.41
SPCS1-201ENST00000233025 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.23□□□□□ -1.41
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.18□□□□□ -1.42
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.17□□□□□ -1.42
SPCS1-201ENST00000233025 MT1EP04732 61 aa6.15□□□□□ -1.42
SPCS1-201ENST00000233025 ROMO1P60602 79 aa6.15□□□□□ -1.42
SPCS1-201ENST00000233025 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.11□□□□□ -1.43
SPCS1-201ENST00000233025 MT1GP13640 62 aa5.99□□□□□ -1.45
SPCS1-201ENST00000233025 PRAC1Q96KF2 57 aa5.99□□□□□ -1.45
SPCS1-201ENST00000233025 PP632Q6XCG6 107 aa5.92□□□□□ -1.46
SPCS1-201ENST00000233025 MT1MQ8N339 61 aa5.92□□□□□ -1.46
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
SPCS1-201ENST00000233025 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.9□□□□□ -1.46
SPCS1-201ENST00000233025 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
SPCS1-201ENST00000233025 MT3P25713 68 aa5.89□□□□□ -1.47
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.89□□□□□ -1.47
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.89□□□□□ -1.47
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa5.87□□□□□ -1.47
SPCS1-201ENST00000233025 LCE1EQ5T753 118 aa5.83□□□□□ -1.48
SPCS1-201ENST00000233025 TNP1P09430 55 aa5.82□□□□□ -1.48
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.82□□□□□ -1.48
SPCS1-201ENST00000233025 MUC5ACP98088 5654 aa5.77□□□□□ -1.49
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.75□□□□□ -1.49
SPCS1-201ENST00000233025 MT1LQ93083 61 aa5.73□□□□□ -1.49
SPCS1-201ENST00000233025 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
SPCS1-201ENST00000233025 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP12-4P60329 112 aa5.53□□□□□ -1.52
SPCS1-201ENST00000233025 LCE3AQ5TA76 89 aa5.5□□□□□ -1.53
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-8O75690 187 aa5.47□□□□□ -1.53
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP12-3P60328 96 aa5.28□□□□□ -1.56
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-2Q701N4 177 aa5.27□□□□□ -1.57
SPCS1-201ENST00000233025 A0A0A0MQY5 61 aa5.25□□□□□ -1.57
SPCS1-201ENST00000233025 OBSCNQ5VST9 7968 aa5.18□□□□□ -1.58
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.11□□□□□ -1.59
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa5.09□□□□□ -1.59
SPCS1-201ENST00000233025 LCE1FQ5T754 118 aa5.07□□□□□ -1.6
SPCS1-201ENST00000233025 LUZP6Q538Z0 58 aa5.02□□□□□ -1.61
SPCS1-201ENST00000233025 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.92□□□□□ -1.62
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa4.89□□□□□ -1.63
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.87□□□□□ -1.63
SPCS1-201ENST00000233025 NDUFAF8A1L188 74 aa4.85□□□□□ -1.63
SPCS1-201ENST00000233025 MT1AP04731 61 aa4.85□□□□□ -1.63
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa4.83□□□□□ -1.64
SPCS1-201ENST00000233025 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.35□□□□□ -1.71
SPCS1-201ENST00000233025 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.11□□□□□ -1.75
SPCS1-201ENST00000233025 INE1O15225 51 aa4.07□□□□□ -1.76
SPCS1-201ENST00000233025 LCE1CQ5T751 118 aa4.01□□□□□ -1.77
SPCS1-201ENST00000233025 PHGR1C9JFL3 82 aa3.9□□□□□ -1.79
SPCS1-201ENST00000233025 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.73□□□□□ -1.81
SPCS1-201ENST00000233025 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.29□□□□□ -1.88
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa3.25□□□□□ -1.89
SPCS1-201ENST00000233025 PRM1P04553 51 aa3.19□□□□□ -1.9
SPCS1-201ENST00000233025 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.97□□□□□ -1.93
SPCS1-201ENST00000233025 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.27□□□□□ -2.05
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